Análise sistêmica do processamento N-terminal e diversidade de proteínas no secretoma de células tumorais

• Processo: 14/06579-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Vigência: 01 de março de 2015 - 28 de fevereiro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: André Zelanis Palitot Pereira
• Beneficiário: André Zelanis Palitot Pereira
• Instituição Sede: Instituto de Ciência e Tecnologia (ICT). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São José dos Campos. São José dos Campos , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/07897-7 - Análise do processamento proteolítico no secretoma de células tumorais de melanoma, BP.IC; 17/01374-2 - Prospecção de marcadores de melanoma associados ao processamento N-terminal protéico em amostras de plasma humano, BP.MS; 15/18096-0 - Otimização de técnicas de enriquecimento nterminal para análise proteômica em larga escala de amostras complexas, BP.TT
• Assunto(s): Peptídeo hidrolases Proteoma Neoplasias Proteômica Biomarcadores
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | N-terminoma | Processamento proteolítico | Proteases | Proteoma | Secretoma | Proteômica

Resumo

A busca por biomarcadores tem sido o foco de diversas pesquisas em biologia tumoral, contudo, estes esforços enfrentam importantes desafios, dada a diversidade etiológica de fatores associados a oncogênese. O desequilíbrio na homeostasia celular causado pela oncogênese tem um efeito expressivo no repertório de proteínas secretadas por células tumorais, bem como sobre os eventos fisiológicos de processamento que ocorrem durante a síntese proteica. Neste sentido, a extremidade N-terminal de proteínas eucarióticas, bem como a diversidade de modificações pós-traducionais (PTMs) presentes no a-amino grupo tem importantes implicações em múltiplos processos biológicos, tais como o endereçamento proteico, atividades biológicas e degradação. Além disso, o processamento proteolítico também é responsável pela geração de novos N-terminais proteicos e é considerado um processo de sinalização celular essencialmente irreversível, que afeta uma diversidade de vias biológicas. Na última década, diversos pesquisadores têm utilizado metodologias de análise e aquisição de dados em larga escala (chamadas "ômicas") no intuito de se entender a diversidade dos secretomas celulares, bem como a complexidade das PTMs em diferentes contextos biológicos. Desta forma, o principal objetivo deste projeto é é identificar, de forma sistêmica, as modificações presentes no N-terminal das proteínas secretadas por células normais e tumorais em cultura, bem como correlacionar os resultados obtidos em cultura com padrões observados em plasma de pacientes normais e tumorais, no intuito de se obter um panorama sistêmico do processo oncogênico e das vias principais vias biológicas associadas ao processamento do N-terminal de proteínas secretadas. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LIBERATO, TARCISIO; FUKUSHIMA, ISABELLA; KITANO, EDUARDO S.; SERRANO, SOLANGE M. T.; CHAMMAS, ROGER; ZELANIS, ANDRE. Proteomic profiling of the proteolytic events in the secretome of the transformed phenotype of melanocyte-derived cells using Terminal Amine Isotopic Labeling of Substrates. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 192, p. 291-298, FEB 10 2019. (14/06579-3, 15/18096-0, 13/07467-1, 17/07897-7)

FRANCISQUINI, RODRIGO; BERTON, RAFAEL; SOARES, SANDRO GOMES; PESSOTTI, DAYELLE S.; CAMACHO, MAURICIO F.; ANDRADE-SILVA, DEBORA; BARCICK, UILLA; SERRANO, SOLANGE M. T.; CHAMMAS, ROGER; NASCIMENTO, MARIA C. V.; et al. Community-based network analyses reveal emerging connectivity patterns of protein-protein interactions in murine melanoma secretome. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 232, FEB 10 2021. (17/22330-3, 15/21660-4, 13/07375-0, 17/24185-0, 14/06579-3, 19/10817-0, 13/07467-1)

DE MORAIS, JULIANA A.; ZELANIS, ANDRE. Bioinformatic reanalysis of public proteomics data reveals that nuclear proteins are recurrent in cancer secretomes. TRAFFIC, v. 23, n. 2, DEC 2021. (19/07282-8, 14/06579-3)

AUGUSTO-DE-OLIVEIRA, CESAR; STUGINSKI, DANIEL R.; KITANO, EDUARDO S.; ANDRADE-SILVA, DEBORA; LIBERATO, TARCISIO; FUKUSHIMA, ISABELLA; SERRANO, SOLANGE M. T.; ZELANIS, ANDRE. Dynamic Rearrangement in Snake Venom Gland Proteome: Insights into Bothrops jararaca Intraspecific Venom Variation. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 15, n. 10, p. 3752-3762, OCT 2016. (13/07467-1, 15/18096-0, 14/06579-3)

DIAS, MATHEUS H.; KITANO, EDUARDO S.; ZELANIS, ANDRE; IWAI, LEO K.. Proteomics and drug discovery in cancer. DRUG DISCOVERY TODAY, v. 21, n. 2, p. 264-277, FEB 2016. (12/20186-9, 11/11308-0, 14/06579-3, 13/07467-1)

PESSOTTI, DAYELLE S.; ANDRADE-SILVA, DEBORA; SERRANO, SOLANGE M. T.; ZELANIS, ANDRE. Heterotypic signaling between dermal fibroblasts and melanoma cells induces phenotypic plasticity and proteome rearrangement in malignant cells. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1868, n. 12, p. 9-pg., 2020-12-01. (14/06579-3, 19/07282-8, 16/16935-7, 13/07467-1)

ZELANIS, ANDRE; SILVA, DEBORA A.; KITANO, EDUARDO S.; LIBERATO, TARCISIO; FUKUSHIMA, ISABELLA; SERRANO, SOLANGE M. T.; TASHIMA, ALEXANDRE K.. A first step towards building spectral libraries as complementary tools for snake venom proteome/peptidome studies. Comparative Biochemistry and Physiology D-Genomics & Proteomics, v. 31, SEP 2019. (13/14651-3, 14/06579-3, 17/20106-9, 13/07467-1, 17/07897-7, 13/13548-4)

SALARDANI, MURILO; BARCICK, UILLA; ZELANIS, ANDRE. Assessing proteolytic events in bioinformatic reanalysis of public secretome data from melanoma cell lines. BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS REPORTS, v. 30, p. 4-pg., 2022-07-01. (14/06579-3, 19/07282-8)

LIBERATO, TARCISIO; PESSOTTI, DAYELLE S.; FUKUSHIMA, ISABELLA; KITANO, EDUARDO S.; SERRANO, SOLANGE M. T.; ZELANIS, ANDRE. Signatures of protein expression revealed by secretome analyses of cancer associated fibroblasts and melanoma cell lines. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 174, p. 1-8, MAR 1 2018. (13/07467-1, 15/18096-0, 14/06579-3, 17/07897-7)

CAMACHO, MAURICIO FROTA; STUGINSKI, DANIEL R.; ANDRADE-SILVA, DEBORA; NISHIYAMA-JR, MILTON Y.; VALENTE, RICHARD H.; ZELANIS, ANDRE. A snapshot of Bothrops jararaca snake venom gland subcellular proteome. Biochimie, v. 214, p. 10-pg., 2023-06-17. (14/06579-3, 19/07282-8)