Novas ferramentas genéticas para Archaea: validação funcional e modelagem da rede regulatória de RNA não codificantes de Halobacterium salinarum

• Processo: 13/04125-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2013
• Data de Término da vigência: 02 de fevereiro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Tie Koide
• Beneficiário: Rafael Silva Rocha
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/09532-0 - Biologia sistêmica do extremófilo Halobacterium salinarum: contribuição dos RNAs não-codificantes ao modelo global de regulação gênica, AP.JP
• Assunto(s): Biologia sistêmica Biologia sintética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Sintetica | biologia sistêmica | Ferramentas genéticas | redes regulatórias | Biologia Sintética e Sistêmica

Resumo

Organismos do grupo Archaea são um excelente objeto de estudo para entender as diferentes estratégias utilizadas pelos seres vivos para colonizar habitats extremos. A presente proposta visa estudar a rede de regulação gênica da arqueia modelo Halobacterium salinarum NRC-1. Em primeiro lugar, se realizará o desenvolvimento e validações de novas ferramentas genéticas modulares para facilitar a manipulação genética desse organismo. Em segundo lugar, se procederá a caracterização funcional de RNAs não codificantes (ncRNAs) e seus mecanismos de controle da expresso gênica em H. salinarum. Finalmente, os dados gerados in vivo serão integrados com os existentes na literatura para implementar um modelo computacional da rede regulatória de H. salinarum contendo tanto fatores transcricionais gerais (GTFs) como ncRNAs, visando assim o entendimento dos mecanismos de adaptação desse organismo a sinais ambientais. Os dados resultantes dessas predições serão validados in vivo utilizando ferramentas moleculares clássicas e novas geradas nesse trabalho. Os resultados esperados para a presente proposta permitirão expandir o conhecimento sobre os mecanismos de adaptação a ambientes extremos nesse organismo modelo, e serão de alta relevância para futuras aplicações biotecnológicas.

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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