Análise das variações no número de cópias no genoma de bovinos Nelore e suas assoc...
- Auxílios pontuais (curta duração)
Processo: | 15/08939-0 |
Linha de fomento: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
Vigência (Início): | 01 de julho de 2015 |
Vigência (Término): | 28 de fevereiro de 2018 |
Área do conhecimento: | Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos |
Convênio/Acordo: | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) |
Pesquisador responsável: | Danísio Prado Munari |
Beneficiário: | Tatiane Cristina Seleguim Chud |
Instituição-sede: | Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil |
Assunto(s): | Bovinos leiteiros Variações do número de cópias de DNA |
Resumo Com avanço das tecnologias genômicas, permitiu-se detectar no genoma de humanos e animais domésticos elevado número de variações estruturais cromossômicas, sendo variação no número de cópias (CNV) nos segmentos de DNA o mais comum. No melhoramento genético de animais domésticos, CNVs podem auxiliar no aperfeiçoamento de características de produção e sanidade, pois a maioria dessas regiões influenciam na expressão de genes com funções biológicas específicas. O objetivo deste trabalho será identificar regiões com variações no número de cópias (CNVR) nos segmentos de DNA em bovinos da raça Girolando e verificar associação destas regiões com característica de produção de leite. Serão utilizados registros de 470 animais da raça Girolando genotipados com painel Illumina BovineSNP50 (54.609 SNP), 200 animais genotipados com painel Illumina BovineHD BeadChip (786.799 SNP) e 3 animais com genoma sequenciado, provenientes da base de dados genômicos da Embrapa Gado de Leite, Juiz de Fora, MG. A identificação dos CNVs será realizada por meio do modelo das cadeias ocultas de Markov implementado no software PennCNV e pelo software RAPTR-SV. Após identificação das CNVR, serão realizados estudos de associação com característica de produção de leite e estas serão validadas por meio da técnica de PCR em tempo real. (AU) | |