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Validação e associação de SNPs não tolerados com características de crescimento muscular e deposição de gordura em galinhas

Processo: 16/13589-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2016
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luiz Lehmann Coutinho
Beneficiário:Priscila Anchieta Trevisoli
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/08704-0 - Identificação de locos de interesse zootécnico na galinha doméstica, AP.TEM
Assunto(s):Técnicas de genotipagem   Genômica   Frangos de corte

Resumo

A galinha doméstica é um importante animal de produção com proteína de alto valor biológico para o consumo da população humana. Os avanços tecnológicos na genômica animal têm contribuído para o desenvolvimento de ferramentas que podem ser utilizadas nos programas de melhoramento genético, como o sequenciamento de nova geração que possibilitou a identificação de polimorfismos e a criação de painéis densos de SNPs para genotipagem em larga escala. O estudo de SNPs em regiões de QTL com ênfase na busca por mutações causais são de grande importância para o melhoramento genético. A identificação de mutações causais permite uma maior compreensão dos processos biológicos envolvidos com o fenótipo de interesse, redução do número de SNPs em um chip e como consequência aumento da confiabilidade e redução do custo de genotipagem. SNPs não tolerados são aqueles que podem alterar a função da proteína, e estes são preditos pela ferramenta SIFT (Sort Intolerant from Tolerant). Neste projeto serão selecionados 48 SNPs não tolerados em regiões de QTL que foram previamente identificados em linhagens experimentais Brasileiras de galinhas da EMBRAPA Suínos e Aves. O objetivo principal é realizar análise de associação desses 48 SNPs com características de crescimento e deposição de gordura em frangos de corte. As informações geradas neste projeto irão ajudar na compreensão dos processos biológicos envolvidos e na identificação de SNPs que poderão ser utilizados em programas de melhoramento genético.

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
TREVISOLI, Priscila Anchieta. Associação de polimorfismos de base única preditos como deletérios com características de carcaça em frangos de corte. 2018. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Piracicaba.

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