Validação e associação de SNPs não tolerados com características de crescimento muscular e deposição de gordura em galinhas

• Processo: 16/13589-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2016
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luiz Lehmann Coutinho
• Beneficiário: Priscila Anchieta Trevisoli
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/08704-0 - Identificação de locos de interesse zootécnico na galinha doméstica, AP.TEM
• Assunto(s): Técnicas de genotipagem Genômica Melhoramento genético animal Polimorfismo genético Frangos de corte
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: estudo de associação | frango de corte | Genômica | Genotipagem | Genômica

Resumo

A galinha doméstica é um importante animal de produção com proteína de alto valor biológico para o consumo da população humana. Os avanços tecnológicos na genômica animal têm contribuído para o desenvolvimento de ferramentas que podem ser utilizadas nos programas de melhoramento genético, como o sequenciamento de nova geração que possibilitou a identificação de polimorfismos e a criação de painéis densos de SNPs para genotipagem em larga escala. O estudo de SNPs em regiões de QTL com ênfase na busca por mutações causais são de grande importância para o melhoramento genético. A identificação de mutações causais permite uma maior compreensão dos processos biológicos envolvidos com o fenótipo de interesse, redução do número de SNPs em um chip e como consequência aumento da confiabilidade e redução do custo de genotipagem. SNPs não tolerados são aqueles que podem alterar a função da proteína, e estes são preditos pela ferramenta SIFT (Sort Intolerant from Tolerant). Neste projeto serão selecionados 48 SNPs não tolerados em regiões de QTL que foram previamente identificados em linhagens experimentais Brasileiras de galinhas da EMBRAPA Suínos e Aves. O objetivo principal é realizar análise de associação desses 48 SNPs com características de crescimento e deposição de gordura em frangos de corte. As informações geradas neste projeto irão ajudar na compreensão dos processos biológicos envolvidos e na identificação de SNPs que poderão ser utilizados em programas de melhoramento genético. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TREVISOLI, PRISCILA ANCHIETA; MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; BOSCHIERO, CLARISSA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; PETRINI, JULIANA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES; LEDUR, MONICA CORREA; MOURAO, GERSON BARRETO; GARRICK, DORIAN; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. A Missense Mutation in the MYBPH Gene Is Associated With Abdominal Fat Traits in Meat-Type Chickens. FRONTIERS IN GENETICS, v. 12, AUG 11 2021. (14/21380-9, 16/13589-0, 16/00569-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

TREVISOLI, Priscila Anchieta. Associação de polimorfismos de base única preditos como deletérios com características de carcaça em frangos de corte. 2018. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.