Alterações genômicas submicroscópicas investigadas por meio da técnica de array-CGH em quadros clínicos específicos: surdez hereditária não sindrômica e defeitos de desenvolvimento mülleriano

• Processo: 09/05620-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Carla Rosenberg
• Beneficiário: Erika Cristina Lopes Burrone de Freitas
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/00898-1 - Desequilíbrios genômicos submicroscópicos em quadros clínicos específicos de anomalias congênitas e deficiência mental, AP.TEM
• Assunto(s): Surdez Citogenética molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alterações cromossômicas | Alterações Müllerianas | Anomalias congênitas | array-CGH | Copy number variation (CNV) | Surdez | Citogenética Molecular

Resumo

Hibridação comparativa de genomas em microarray ou array-CGH (aCGH) é uma técnica que permite investigar perdas e ganhos de sequências de DNA no genoma inteiro com resolução 2-3 ordens de magnitude maior do que a citogenética clássica. O uso da técnica de aCGH na pesquisa acelerou o passo de descobertas na genética humana. A alta resolução oferecida pela técnica vem sendo usada para definir regiões de gênicas supostamente responsáveis por doenças humanas e torna-se então uma ferramenta potente para investigar malformações nas quais a etiologia ainda é desconhecida. Como as aberrações cromossômicas são frequentemente associadas a anomalias congênitas e dismorfismos, essas alterações também estão envolvidas na etiologia da surdez hereditária não sindrômica e dos defeitos de desenvolvimento mülleriano.Estudos prévios de nosso grupo com BAC arrays mostrou uma frequência inusitadamente alta de alterações submicroscópicas (~30%), tanto no grupo de surdez sindrômica quanto no de anomalias müllerianas. As amostras desses estudos eram compostas de indivíduos sindrômicos, por eles apresentarem maior probabilidade de portarem alterações genômicas grandes incluindo vários genes. Como a resolução média nos BAC arrays que foram usados era de 1 Mb, alterações pequenas dificilmente seriam detectadas. O presente projeto pretende investigar alterações no número de cópias de sequências de DNA nas amostras de surdez familial e anomalias müllerianas utilizando uma plataforma de oligonucleotídeos de alta resolução (e 80 Kb). Assim será possível procurar alterações menores com mapeamentos mais precisos, não sendo necessário selecionar indivíduos sindrômicos para chegar a novos genes relacionados a esses quadros.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DANTAS, VITOR G. L.; FREITAS, ERIKA L.; DELLA-ROSA, VALTER A.; LEZIROVITZ, KARINA; DE MORAES, ANA MARIA S. M.; RAMOS, SILVIA B.; OITICICA, JEANNE; ALVES, LEANDRO U.; PEARSON, PETER L.; ROSENBERG, CARLA; et al. Novel partial duplication of EYA1 causes branchiootic syndrome in a large Brazilian family. INTERNATIONAL JOURNAL OF AUDIOLOGY, v. 54, n. 9, p. 593-598, 2015. (09/00898-1, 09/05620-1, 03/04780-9, 98/14254-2)