Autor(es):Mostrar menos -

Candido, Darlan S. ^{[1, 2]} ; Claro, Ingra M. ^{[2, 3]} ; de Jesus, Jaqueline G. ^{[2, 3]} ; Souza, William M. ^[4] ; Moreira, Filipe R. R. ^[5] ; Dellicour, Simon ^{[6, 7]} ; Mellan, Thomas A. ^[8] ; du Plessis, Louis ^[1] ; Pereira, Rafael H. M. ^[9] ; Sales, Flavia C. S. ^{[2, 3]} ; Manuli, Erika R. ^{[2, 3]} ; Theze, Julien ^[10] ; Almeida, Luiz ^[11] ; Menezes, Mariane T. ^[5] ; Voloch, Carolina M. ^[5] ; Fumagalli, Marcilio J. ^[4] ; Coletti, Thais M. ^{[2, 3]} ; Silva, Camila A. M. ^{[2, 3]} ; Ramundo, Mariana S. ^{[2, 3]} ; Amorim, Mariene R. ^[12] ; Hoeltgebaum, Henrique H. ^[13] ; Mishra, Swapnil ^[8] ; Gill, Mandev S. ^[7] ; Carvalho, Luiz M. ^[14] ; Buss, Lewis F. ^[2] ; Prete Jr, Carlos A. ; Ashworth, Jordan ^[15] ; Nakaya, I, Helder ; Peixoto, Pedro S. ^[16] ; Brady, Oliver J. ^{[17, 18]} ; Nicholls, Samuel M. ^[19] ; Tanuri, Amilcar ^[5] ; Rossi, Atila D. ^[5] ; Braga, V, Carlos K. ; Gerber, Alexandra L. ^[11] ; Guimaraes, Ana Paula de C. ^[11] ; Gaburo Jr, Nelson ; Alencar, Cecila Salete ^[20] ; Ferreira, Alessandro C. S. ^[21] ; Lima, Cristiano X. ^{[22, 23]} ; Levi, Jose Eduardo ^[24] ; Granato, Celso ^[25] ; Ferreira, Giulia M. ^[26] ; Francisco Jr, Ronaldo S. ; Granja, Fabiana ^{[12, 27]} ; Garcia, Marcia T. ^[28] ; Moretti, Maria Luiza ^[28] ; Perroud Jr, Mauricio W. ; Castineiras, Terezinha M. P. P. ^[29] ; Lazari, Carolina S. ^[30] ; Hill, Sarah C. ^{[1, 31]} ; de Souza Santos, Andreza Aruska ^[32] ; Simeoni, Camila L. ^[12] ; Forato, Julia ^[12] ; Sposito, Andrei C. ^[33] ; Schreiber, Angelica Z. ^[34] ; Santos, Magnun N. N. ^[34] ; de Sa, Camila Zolini ^[35] ; Souza, Renan P. ^[35] ; Resende-Moreira, Luciana C. ^[36] ; Teixeira, Mauro M. ^[37] ; Hubner, Josy ^[38] ; Leme, Patricia A. F. ^[39] ; Moreira, Rennan G. ^[40] ; Nogueira, Mauricio L. ^[41] ; Ferguson, Neil M. ^[8] ; Costa, Silvia F. ^{[2, 3]} ; Proenca-Modena, Jose Luiz ^[12] ; Vasconcelos, Ana Tereza R. ^[42] ; Bhatt, Samir ^[8] ; Lemey, Philippe ^[7] ; Wu, Chieh-Hsi ^[43] ; Rambaut, Andrew ^[44] ; Loman, Nick J. ^[19] ; Aguiar, Renato S. ^[35] ; Pybus, Oliver G. ^[1] ; Sabino, Ester C. ^[3] ; Faria, Nuno Rodrigues ^{[2, 8]} ; Discovery, Brazil-UK Ctr Arbovirus

Afiliação do(s) autor(es):Mostrar menos -

^[1] Univ Oxford, Dept Zool, Oxford - England

^[2] Univ Sao Paulo, Fac Med, Inst Med Trop, Sao Paulo - Brazil

^[3] Univ Sao Paulo, Fac Med, Dept Molestias Infecciosas & Parasitaries, Sao Paulo - Brazil

^[4] Fac Med Ribeirao Preto, Ctr Pesquisa Virol, Ribeirao Preto - Brazil

^[5] Univ Fed Rio de Janeiro, Dept Genet, Inst Biol, Rio De Janeiro - Brazil

^[6] Univ Libre Bruxelles, Spatial Epidemiol Lab, Brussels - Belgium

^[7] Katholieke Univ Leuven, Dept Microbiol Immunol & Transplantat, Rega Inst, Leuven - Belgium

^[8] Imperial Coll London, MRC Ctr Global Infect Dis Anal, J IDEA, London - England

^[9] V, Inst Appl Econ Res, Brasilia, DF - Brazil

^[10] Univ Clermont Auvergne, VetAgro Sup, INRAE, UMR EPIA, St Genes Champanelle - France

^[11] Lab Bioinformat, Lab Natl Comp Cient, Petropolis - Brazil

^[12] Univ Estadual Campinas, Dept Genet Evolucao Microbiol & Imunol, Inst Biol, Campinas - Brazil

^[13] Imperial Coll London, Dept Math, London - England

^[14] Fundacao Getalio Vargas, Escola Matemat Aplicada EMAp, Rio De Janeiro - Brazil

^[15] Univ Edinburgh, Usher Inst, Edinburgh, Midlothian - Scotland

^[16] Univ Sao Paulo, Inst Matemat & Estat, Dept Matemat Aplicada, Sao Paulo - Brazil

^[17] London Sch Hyg & Trop Med, Dept Infect Dis Epidemiol, Fac Epidemiol & Populat Hlth, London - England

^[18] London Sch Hyg & Trop Med, Ctr Math Modelling Infect Dis, London - England

^[19] Univ Birmingham, Inst Microbiol & Infect, Birmingham, W Midlands - England

^[20] Univ Sao Paulo, LIM Lab Med Lab 03, Hosp Clin, Fac Med, Sao Paulo - Brazil

^[21] Inst Hermes Pardini, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[22] Univ Fed Minas Gerais, Fac Med, Dept Cirurgia, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[23] Simile Inst Imunol Aplicada Ltda, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[24] Lab DASA, Sao Paulo - Brazil

^[25] Lab Fleury, Sao Paulo - Brazil

^[26] Univ Fed Uberlandia, Inst Glandes Biomed, Lab Virol, Uberlandia, MG - Brazil

^[27] Univ Fed Roraima, Ctr Estudos Biodiversidade, Boa Vista, Parana - Brazil

^[28] Univ Estadual Campinas, Fac Ciencias Med, Div Doences Infecciacas, Campinas, SP - Brazil

^[29] Univ Fed Rio de Janeiro, Fac Med, Dept Doencas Infeccioses & Parasitarias, Rio De Janeiro - Brazil

^[30] Univ Sao Paulo, Cent Hosp Clin, Fac Med, Div Lab, Sao Paulo - Brazil

^[31] Royal Vet Coll, Dept Pathobiol & Populat Sci, Hatfield, Herts - England

^[32] Univ Oxford, Latin Amer Ctr, Oxford Sch Global & Area Studies, Oxford - England

^[33] Univ Estadual Campinas, Fac Ciencias Med, Dept Clin Med, Campinas, SP - Brazil

^[34] Univ Estadual Campinas, Dept Patol, Fac Ciencias Med, Campinas, SP - Brazil

^[35] Univ Fed Minas Gerais, Dept Genet Ecol & Evolucao, Inst Ciencias Biol, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[36] Univ Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Dept Bot, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[37] Univ Fed Minas Gerais, Dept Bioquim & Imunol, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[38] Univ Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Dept Biol Celular, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[39] Univ Estadual Campinas, Ctr Saude Comunidade, Campinas, SP - Brazil

^[40] Univ Fed Minas Gerais, Ctr Labs Multiusuarios, Inst Ciencias Biol, Belo Horizonte, MG - Brazil

^[41] Fac Med Sao Jose do Rio Preto, Lab Pesquisas Virol, Sao Jose Do Rio Preto, SP - Brazil

^[42] Francisco Jr, Jr., Ronaldo S., Lab Bioinformat, Lab Natl Comp Cient, Petropolis - Brazil

^[43] Univ Southampton, Math Sci, Southampton, Hants - England

^[44] Univ Edinburgh, Inst Evolutionary Biol, Edinburgh, Midlothian - Scotland

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Science; v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020.
• Citações Web of Science: 124

Resumo

Brazil currently has one of the fastest-growing severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) epidemics in the world. Because of limited available data, assessments of the impact of nonpharmaceutical interventions (NPIs) on this virus spread remain challenging. Using a mobility-driven transmission model, we show that NPIs reduced the reproduction number from >3 to 1 to 1.6 in Sao Paulo and Rio de Janeiro. Sequencing of 427 new genomes and analysis of a geographically representative genomic dataset identified >100 international virus introductions in Brazil. We estimate that most (76%) of the Brazilian strains fell in three clades that were introduced from Europe between 22 February and 11 March 2020. During the early epidemic phase, we found that SARS-CoV-2 spread mostly locally and within state borders. After this period, despite sharp decreases in air travel, we estimated multiple exportations from large urban centers that coincided with a 25% increase in average traveled distances in national flights. This study sheds new light on the epidemic transmission and evolutionary trajectories of SARS-CoV-2 lineages in Brazil and provides evidence that current interventions remain insufficient to keep virus transmission under control in this country. (AU)

• Processo FAPESP: 20/04558-0 - Caracterização de fatores de risco intrínsecos e o desenvolvimento de novas alternativas de diagnóstico e tratamento para covid-19
• Beneficiário: José Luiz Proença Módena
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 16/00194-8 - Patogênese e neurovirulência de vírus emergentes no Brasil
• Beneficiário: José Luiz Proença Módena
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 19/21301-5 - Identificação de Flavivirus e Alphavirus em mosquitos (Diptera: Culicidae) coletados na cidade de São Paulo
• Beneficiário: Camila Alves Maia da Silva Fonzaghi
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Processo FAPESP: 18/14389-0 - Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovirus (CADDE)
• Beneficiário: Ester Cerdeira Sabino
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 18/14933-2 - Biologia Integrativa Aplicada à Saúde Humana
• Beneficiário: Helder Takashi Imoto Nakaya
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores - Fase 2
• Processo FAPESP: 17/13981-0 - Caracterização, genômica e diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 20/04836-0 - Estudo clínico e epidemiológico de SARS-CoV-2 em uma coorte prospectiva populacional e hospitalar em São José do Rio Preto, São Paulo, Brasil, durante pandemia de 2020.
• Beneficiário: Maurício Lacerda Nogueira
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 18/25468-9 - Análise da Expressão dos Retrovírus Endógenos Humanos em Pacientes infectados pelo HTLV.
• Beneficiário: Flavia Cristina da Silva Sales
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 16/18445-7 - Métodos numéricos para a nova geração de modelos de previsão de tempo e clima
• Beneficiário: Pedro da Silva Peixoto
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 18/09383-3 - Estudo sobre epítopos de Flavivirus com importância médica no Brasil e de seus anticorpos
• Beneficiário: Marcilio Jorge Fumagalli
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 18/17176-8 - Em tempo real, rápida detecção e sequenciamento de arbovírus no Brasil: Zika, Dengue, Chikungunya e Febre amarela
• Beneficiário: Ingra Morales Claro
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 19/12000-1 - Modelagem da dispersão espaço-temporal de arbovírus emergentes usando fontes de dados heterogêneas no Estado de São Paulo
• Beneficiário: Jaqueline Goes de Jesus
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 19/07544-2 - Coletas de campo de mosquito e identificação de código de barras COI usando a tecnologia MinION
• Beneficiário: Thaís de Moura Coletti
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Processo FAPESP: 19/24251-9 - Abordagens multi-ômicas para o estudo da doença por Chikungunya
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado