Characterization of the RNA-dependent RNA polymerase from Chikungunya virus and discovery of a novel ligand as a potential drug candidate

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Freire, Marjorie C. L. C. ; Basso, Luis G. M. ; Mendes, Luis F. S. ; Mesquita, Nathalya C. M. R. ; Mottin, Melina ; Fernandes, Rafaela S. ; Policastro, Lucca R. ; Godoy, Andre S. ; Santos, Igor A. ; Ruiz, Uriel E. A. ; Caruso, Icaro P. ; Sousa, Bruna K. P. ; Jardim, Ana C. G. ; Almeida, Fabio C. L. ; Gil, Laura H. V. G. ; Andrade, Carolina H. ; Oliva, Glaucius

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC REPORTS; v. 12, n. 1, p. 15-pg., 2022-06-22.

Resumo

Chikungunya virus (CHIKV) is the causative agent of Chikungunya fever, an acute febrile and arthritogenic illness with no effective treatments available. The development of effective therapeutic strategies could be significantly accelerated with detailed knowledge of the molecular components behind CHIKV replication. However, drug discovery is hindered by our incomplete understanding of their main components. The RNA-dependent RNA-polymerase (nsP4-CHIKV) is considered the key enzyme of the CHIKV replication complex and a suitable target for antiviral therapy. Herein, the nsP4-CHIKV was extensively characterized through experimental and computational biophysical methods. In the search for new molecules against CHIKV, a compound designated LabMol-309 was identified as a strong ligand of the nsp4-CHIKV and mapped to bind to its active site. The antiviral activity of LabMol-309 was evaluated in cellular-based assays using a CHIKV replicon system and a reporter virus. In conclusion, this study highlights the biophysical features of nsP4-CHIKV and identifies a new compound as a promising antiviral agent against CHIKV infection. (AU)

• Processo FAPESP: 18/17095-8 - Caracterização estrutural da proteína NSP4 RNA polimerase RNA-dependente do Vírus Chikungunya e busca por agentes antivirais
• Beneficiário: Marjorie Caroline Liberato Cavalcanti Freire
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 18/05130-3 - Construção e caracterização de um sistema replicon sub-genômico do ZIKV para a descoberta de agentes antivirais.
• Beneficiário: Rafaela Sachetto Fernandes
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 15/16812-0 - EMU concedido no processo 2014/15546-1: SEC-MALS
• Beneficiário: Richard Charles Garratt
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 21/10465-7 - Explorando a dinâmica de agregação/desagregação de uma proteína da matriz de Golgi sob condições de estresse
• Beneficiário: Luis Felipe Santos Mendes
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos
• Beneficiário: Glaucius Oliva
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 17/24669-8 - Desvendando as bases moleculares de processos iniciais da secreção de proteínas em humanos utilizando técnicas biofísicas
• Beneficiário: Luis Felipe Santos Mendes
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 21/01706-0 - Triagem de compostos para a identificação de fármacos contra o vírus Chikungunya utilizando sistema replicon subgenômico
• Beneficiário: Lucca Rocha Policastro
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica