RAMAN SPECTROSCOPY TECHNIQUES ASSOCIATED WITH BIOINFORMATICS APPLIED TO CELL PHENOTYPING MICE SKELETAL MUSCLES

• Grant number: 24/07162-0
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: June 01, 2024
• End date: March 31, 2026
• Field of knowledge: Physical Sciences and Mathematics - Physics - Condensed Matter Physics
• Principal Investigator: Anderson Zanardi de Freitas
• Grantee: André Mourão Batista
• Host Institution: Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN). São Paulo , SP, Brazil
• Associated research grant: 23/04564-8 - PHENOTYPIC CHARACTERIZATION BY RAMAN MICROSCOPY, TERS AND SNOM IN SKELETAL MUSCLE FIBERS OF MICE, AP.R

Abstract

O trabalho do bolsista TT-4A consistirá na aplicação de ferramentas da Bioinformática, focado na Bioestatística e Biofotônica, utilizadas para fenotipagem de células músculo esqueléticas de camundongos, através do uso de dados da caracterização espectroscópica Raman de células previamente mapeadas por ensaios de imunofluorescência clássica. O trabalho será realizado com a parte experimental de análises de microscopia ¼-Raman, Tip Enhanced Raman Spectroscopy (TERS), Scanning near-field optical microscopy (SNOM), Atomic Force microscopy (AFM) com co-localização TERS, e posteriormente o tratamento de dados dos espectros Raman, comparando a semelhança espectral das amostras com os dados de referência (média dos espectros Raman que seja representativo dos tipos de fibras musculares) por software KnowItall® e utilização de ferramentas de linguagem de programação Python ou Rpara aplicação de análise multivariada como, análise de componente principal (PCA) e análise discriminante com calibração multivariada por mínimos quadrados parciais (PLS-DA), no intuito de encontrar padrões analíticos capazes de reconhecer e distinguir os tipos de fibras musculares.