Genetic analyses (Cytogenetics, SANGER, and Genomics) and management of the molecular laboratory.

• Grant number: 25/20658-8
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: November 01, 2025
• End date: May 31, 2027
• Field of knowledge: Biological Sciences - Genetics - Animal Genetics
• Principal Investigator: Alexandre Reis Percequillo
• Grantee: Ana Lazar Gomes e Souza
• Host Institution: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brazil
• Associated research grant: 20/11444-0 - Diversity of neotropical rodents (Rodentia: Sciuridae, Cricetidae, Echimyidae): origin, evolution and biogeography, AP.TEM

Abstract

As amostras coletadas nas expedições do projeto Temático "Diversidade de Roedores Neotropicais (Rodentia: Sciuridae, Cricetidae, Echimyidae): Origem, Evolução e Biogeografia" serão preparadas no laboratório para sequenciamento Sanger e de Nova Geração, Genômico. Em um primeiro momento as amostras serão sequenciadas para os marcadores moleculares mitocondriais citocromo b (citb) e citocromo oxidase subunidade I (COI). As sequências geradas serão analisadas através de abordagens filogenéticas e populacionais para identificação preliminar das amostras e detecção de questões a serem aprofundadas. A partir destas análises, as amostras serão selecionadas para o sequenciamento de Nova Geração. O bolsista será também treinado para a confecção das bibliotecas para o sequenciamento genômico. Adicionalmente, bolsista será responsável pela preparação dos cariótipos de todas as espécies em laboratório. A citogenética é uma ferramenta complementar para auxiliar na identificação das espécies e entender a diversidade genética de cada táxon. Por estas razões, pretendemos contratar um bolsista TT-V que tenha experiência para conduzir as práticas laboratoriais e realizar as análises moleculares e citogenéticas preliminares das amostras coletadas. O bolsista irá ainda ensinar e auxiliar os bolsistas de IC e PG nas técnicas de laboratório e no desenvolvimento de seus projetos, além de auxiliar no gerenciamento e manutenção do laboratório molecular.