Busca avançada
Ano de início
Entree

Representação, Caracterização e Modelagem de Imagens Biológicas Utilizando Redes Complexas

Processo: 18/09125-4
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de dezembro de 2018 - 30 de novembro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
Pesquisador responsável:Cesar Henrique Comin
Beneficiário:Cesar Henrique Comin
Instituição-sede: Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia (CCET). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Microscopia confocal  Processamento de imagens  Vasos sanguíneos 

Resumo

A representação de sistemas através da sua topologia, na forma de redes ou grafos, tem despertado muito interesse nos últimos anos. Tal interesse culminou no surgimento da área hoje conhecida como teoria de redes complexas. A proposta deste projeto é aplicar uma série de resultados recentes da área de redes complexas para a análise de imagens biológicas, com a finalidade de revelarmos propriedades dessas imagens usualmente não observadas através de metodologias tradicionais. Esse objetivo envolve três aspectos fundamentais de estudo, dados pela i) definição de representações adequadas de imagens através de redes, ii) escolha de propriedades topológicas apropriadas para caracterizar os dados e iii) criação de modelos matemáticos dos sistemas estudados. Descreveremos os desafios esperados para cada um dos aspectos considerados e possíveis abordagens que serão utilizadas para solucioná-los. Mostraremos que diversos métodos de redes complexas podem ser utilizados para a análise de imagens obtidas dos mais diferentes sistemas biológicos. Especial enfoque será dado para sistemas que possuem representações naturais em redes, como vasos sanguíneos e neurônios, mas outras aplicações serão consideradas. Pretendemos aplicar os conceitos desenvolvidos para auxiliar pesquisas de fronteira em biologia, através de colaborações com pesquisadores da área. (AU)

Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
COMIN, CESAR H.; PERON, THOMAS; SILVA, FILIPI N.; AMANCIO, DIEGO R.; RODRIGUES, FRANCISCO A.; COSTA, LUCIANO DA F. Complex systems: Features, similarity and connectivity. PHYSICS REPORTS-REVIEW SECTION OF PHYSICS LETTERS, v. 861, p. 1-41, MAY 25 2020. Citações Web of Science: 0.
CIBA, MANUEL; BESTEL, ROBERT; NICK, CHRISTOPH; DE ARRUDA, GUILHERME FERRAZ; PERON, THOMAS; HENRIQUE, COMIN CESAR; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA; RODRIGUES, FRANCISCO APARECIDO; THIELEMANN, CHRISTIANE. Comparison of Different Spike Train Synchrony Measures Regarding Their Robustness to Erroneous Data From Bicuculline-Induced Epileptiform Activity. NEURAL COMPUTATION, v. 32, n. 5, p. 887-911, MAY 2020. Citações Web of Science: 0.
COMIN, CESAR H.; TAYLOR, GAVIN J.; COSTA, LUCIANO DA F. Quantifying the regularity of a 3D set of points on the surface of an ellipsoidal object. PATTERN RECOGNITION LETTERS, v. 133, p. 1-7, MAY 2020. Citações Web of Science: 0.
BENATTI, ALEXANDRE; DE ARRUDA, HENRIQUE F.; SILVA, FILIPI NASCIMENTO; COMIN, CESAR HENRIQUE; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. Opinion diversity and social bubbles in adaptive Sznajd networks. JOURNAL OF STATISTICAL MECHANICS-THEORY AND EXPERIMENT, v. 2020, n. 2 FEB 2020. Citações Web of Science: 0.
SILVA, FILIPI N.; COMIN, CESAR H.; COSTA, LUCIANO DA F. Malleability of complex networks. JOURNAL OF STATISTICAL MECHANICS-THEORY AND EXPERIMENT, AUG 2019. Citações Web of Science: 0.
DE ARRUDA, HENRIQUE F.; COMIN, CESAR H.; COSTA, LUCIANO DA F. Problem-solving using complex networks. European Physical Journal B, v. 92, n. 6 JUN 2019. Citações Web of Science: 0.
RODRIGUEZ, MAYRA Z.; COMIN, CESAR H.; CASANOVA, DALCIMAR; BRUNO, ODEMIR M.; AMANCIO, DIEGO R.; COSTA, LUCIANO DA F.; RODRIGUES, FRANCISCO A. Clustering algorithms: A comparative approach. PLoS One, v. 14, n. 1 JAN 15 2019. Citações Web of Science: 8.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.