Estudos estruturais da LGI1 humana

• Processo: 05/03234-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2006
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica
• Pesquisador responsável: Ricardo Aparicio
• Beneficiário: Ricardo Aparicio
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Epilepsia do lobo temporal LGI1 Cristalografia de proteínas Espalhamento de raios X a baixos ângulos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cd | Cristalografia De Proteinas | Dls | Epilepsia | Lg11 | Saxs | Cristalografia de Proteínas

Resumo

A epilepsia de lobo temporal é a mais frequente das epilepsias parciais. A proteína humana LGI1 está relacionada à epilepsia do lobo temporal com sintomas auditivos (ADLTE), uma das formas familiares de epilepsia de lobo temporal. As informações disponíveis sobre a estrutura da LGI1 são baseadas em análises in silico. Um maior conhecimento de sua função, ainda ignorada, é primordial para o entendimento da epileptogênese. Este projeto tem como objetivos a determinação da estrutura cristalográfica da LGI1 humana e a realização de estudos estruturais da proteína em solução. As informações obtidas da estrutura de alta resolução resolvida por Cristalografia serão complementadas com as da estrutura em solução determinada por SAXS. O uso combinado destas técnicas será de grande valia para uma compreensão mais profunda de características estruturais que podem ser indicativos da função da LGI1, ajudando na predição de sítios funcionais e de interação com ligantes e outras proteínas. A proteína será obtida por expressão recombinante em trabalho colaborativo com a Profa. Dra. Iscia Teresinha Lopes-Cendes, FCM/Unicamp, que coordena estudos de genética médica visando identificar proteínas com as quais a LGI1 interage. A proteína será submetida a estudos por Cristalografia e SAXS após análise prévia por CD (verificação de integridade estrutural) e DLS (verificação de agregados). Com exceção da coleta de dados de SAXS e Cristalografia, todas as etapas da análise estrutural serão realizadas no IQ/Unicamp. As investigações propostas podem contribuir de maneira significativa para o entendimento, em nível atômico e molecular, de interações relacionadas ao mecanismo da ADLTE e à epileptogênese. Em âmbito mais geral, o projeto é parte de uma iniciativa para estabelecer um grupo de Cristalografia de Proteínas no Instituto de Química da Unicamp. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DOS REIS, MARCELO AUGUSTO; SARAIVA, ANTONIO MARCOS; DOS SANTOS, MARCELO LEITE; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; APARICIO, RICARDO. Crystallization and preliminary X-ray analysis of stationary phase survival protein E (SurE) from Xylella fastidiosa in two crystal forms. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 68, n. 4, p. 464-467, APR 2012. (01/07533-7, 05/03234-6)

PEREIRA MACHADO, AGNES THIANE; BARRETO FONSECA, EMANUELLA MARIA; DOS REIS, MARCELO AUGUSTO; SARAIVA, ANTONIO MARCOS; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; SZYMANSKI DE TOLEDO, MARCELO AUGUSTO; POLIKARPOV, IGOR; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; APARICIO, RICARDO; IULEK, JORGE. Conformational variability of the stationary phase survival protein E from Xylella fastidiosa revealed by X-ray crystallography, small-angle X ray scattering studies, and normal mode analysis. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 85, n. 10, p. 1931-1943, OCT 2017. (12/51580-4, 08/55690-3, 05/03234-6, 04/02540-3, 11/15792-4, 06/52844-4, 01/07533-7)

MURAI, MARCELO J.; SASSONIA, ROGERIO C.; ZAMBONI, ANDRE H.; CONTE, FABIO F.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; APARICIO, RICARDO; DE OLIVEIRA, MARCELO G.; LOPES-CENDES, ISCIA. Characterization of the C-terminal half of human juvenile myoclonic epilepsy protein EFHC1: Dimer formation blocks Ca2+ and Mg2+ binding to its functional EF-hand. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 477, n. 1, p. 131-138, SEP 1 2008. (05/03234-6, 04/03600-0)

SARAIVA, ANTONIO M.; REIS, MARCELO A.; TADA, SUSELY F.; ROSSELLI-MURAI, LUCIANA K.; SCHNEIDER, DILAINE R. S.; PELLOSO, ALEXANDRE C.; TOLEDO, MARCELO A. S.; GILES, CARLOS; APARICIO, RICARDO; DE SOUZA, ANETE P.. Functional and small-angle X-ray scattering studies of a new stationary phase survival protein E (SurE) from Xylella fastidiosa - evidence of allosteric behaviour. FEBS Journal, v. 276, n. 22, p. 6751-6762, 2009. (01/07533-7, 05/03234-6)

DOS REIS, MARCELO AUGUSTO; SARAIVA, ANTONIO MARCOS; DOS SANTOS, MARCELO LEITE; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; APARICIO, RICARDO. Crystallization and preliminary X-ray analysis of stationary phase survival protein E (SurE) from Xylella fastidiosa in two crystal forms. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 68, p. 4-pg., 2012-04-01. (05/03234-6, 01/07533-7)