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(bioen-fapesp) library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome

Processo:08/58037-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Jovens Pesquisadores
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2009
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Fábio Márcio Squina
Beneficiário:Fábio Márcio Squina
Instituição Sede:Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Campinas , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:Campinas
Auxílio(s) vinculado(s):10/18198-3 - Biologia de Sistemas das Interações Microbianas na Decomposição do Bagaço de cana, AV.EXT
Bolsa(s) vinculada(s):13/09541-4 - Estudos genômicos da expressão gênica global de Aspergillus niger crescido em bagaço e colmo de cana-de-açúcar, BP.MS
13/03061-0 - Aplicação de abordagens químicas e biológicas para valorização da lignina, BP.DR
12/19040-0 - Caracterização da expressão gênica do fungo Neurospora crassa na desconstrução do bagaço de cana de açúcar, BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 12/18859-5 - Desenvolvimento de um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de bagaço de cana de açúcar, BP.PD
11/14200-6 - Estudos funcionais de hemicelulases microbianas com potencial aplicação biotecnológica em biorrefinarias de biomassas hemicelulósicas, BP.MS
11/02169-7 - Aspergillus nidulans como modelo para expressão heteróloga de celulases e hemicelulases, BP.PD
10/11469-1 - "Desenvolvimento de uma biblioteca de Enzimas a partir de Metagenoma de Solo", BP.DD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Enzimas  Solos  Metagenoma  Conversão de biomassa  Bioenergia 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Celulases | Conversao Da Biomassa | Hemicelulases | Metagenome
Publicação FAPESP:https://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/pasta_bioen_jun2012_54.pdf

Resumo

A mudança gradual do petróleo para recursos de biomassa renováveis é geralmente vista como uma importante contribuição para o desenvolvimento de uma sociedade industrial sustentável e o manejo eficaz de emissões de gases de efeito estufa. Materiais lignocelulósicos são fontes abundantes e baratas de energia armazenada na biosfera. Assim, a conversão de biomassa em açúcares como matéria-prima avançou para a linha de frente da indústria de biocombustíveis. No entanto, a sacarificação de biomassa vegetal é um processo complexo e demorado, principalmente em razão da recalcitrância inerente e da heterogeneidade complexa dos polímeros que formam as paredes das células vegetais. A biomassa lignocelulósica precisa passar por uma etapa de pré-tratamento intensivo, após a qual enzimas são usadas para quebrar a biomassa polissacarídea em açúcar simples adequado para a fermentação e a produção de etanol. Visando a exploração total dos polissacarídeos da parede da célula vegetal como uma fonte de energia ambientalmente renovável, um extenso repertório de enzimas hidrolíticas desempenharia importante papel para a produção de biocombustíveis. O objetivo desta proposta é a geração de um kit de ferramentas de enzimas lignocelulósicas com uma ampla gama de aplicações biotecnológicas, incluindo seu uso como atores para o desenvolvimento de estratégias para a produção de etanol de segunda geração. A prospecção dessas enzimas será feita a partir do metagenoma do solo, que contempla uma estratégia pioneira para a prospecção de enzimas de conversão de biomassa a partir de microrganismos não convencionalmente cultiváveis. Adicionalmente, este estudo pode contribuir intensivamente para o desenvolvimento do campo da bioenergia ao melhorar técnicas para a rápida detecção de hidrólise usando eletroforese capilar e implementando a expressão de genes heterólogos em fungos filamentosos. (AU)

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Publicações científicas (28)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
SQUINA, FABIO MARCIO; PRADE, ROLF ALEXANDER; WANG, HONGLIANG; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of an endo-1,5-alpha-L-arabinanase from hyperthermophilic Thermotoga petrophila. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 65, n. 9, p. 902-905, . (08/58037-9)
MANDELLI, F.; FRANCO CAIRO, J. P. L.; CITADINI, A. P. S.; BUECHLI, F.; ALVAREZ, T. M.; OLIVEIRA, R. J.; LEITE, V. B. P.; PAES LEME, A. F.; MERCADANTE, A. Z.; SQUINA, F. M.. . Letters in Applied Microbiology, v. 57, n. 1, p. 40-46, . (08/58037-9, 11/17658-3)
COLUSSI, FRANCIELI; DA SILVA, VIVIAM M.; MILLER, IAN; COTA, JUNIO; DE OLIVEIRA, LEANDRO C.; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; SQUINA, FABIO M.; GARCIA, WANIUS. . Amino Acids, v. 47, n. 5, p. 937-948, . (12/21054-9, 08/58037-9, 12/03503-0, 11/13242-7)
COTA, JUNIO; CORREA, THAMY L. R.; DAMASIO, ANDRE R. L.; DIOGO, JOSE A.; HOFFMAM, ZAIRA B.; GARCIA, WANIUS; OLIVEIRA, LEANDRO C.; PRADE, ROLF A.; SQUINA, FABIO M.. . NEW BIOTECHNOLOGY, v. 32, n. 1, p. 13-20, . (12/21054-9, 11/13242-7, 08/58037-9, 10/18198-3)
BRAGATTO, J.; SEGATO, F.; SQUINA, F. M.. . INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS, v. 51, p. 123-129, . (08/58037-9)
ALVAREZ, THABATA M.; PAIVA, JOICE H.; RUIZ, DIEGO M.; CAIRO, JOAO PAULO L. F.; PEREIRA, ISABELA O.; PAIXAO, DOUGLAS A. A.; DE ALMEIDA, RODRIGO F.; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; SANTOS, CAMILA R.; et al. . PLoS One, v. 8, n. 12, . (13/13309-0, 11/20977-3, 10/11469-1, 09/08312-6, 08/58037-9)
DE OLIVEIRA, LEANDRO C.; DA SILVA, VIVIAM M.; COLUSSI, FRANCIELI; CABRAL, ALINE D.; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; SQUINA, FABIO M.; GARCIA, WANIUS. . PLoS One, v. 10, n. 2, . (12/21054-9, 08/58037-9, 12/03503-0, 11/13242-7)
FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; UCHIMA, CRISTIANE A.; ALVAREZ, THABATA M.; CITADINI, ANA PAULA DA S.; COTA, JUNIO; LEONARDO, FLAVIA COSTA; COSTA-LEONARDO, ANA M.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; COSTA, FERNANDO F.; et al. . Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 43, n. 10, p. 970-981, . (12/19040-0, 11/08609-9, 11/20977-3, 11/13242-7, 10/11469-1, 08/58037-9)
DE LIMA DAMASIO, ANDRE RICARDO; RUBIO, MARCELO VENTURA; GONCALVES, THIAGO AUGUSTO; PERSINOTI, GABRIELA FELIX; SEGATO, FERNANDO; PRADE, ROLF ALEXANDER; CONTESINI, FABIANO JARES; DE SOUZA, AMANDA PEREIRA; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; SQUINA, FABIO MARCIO. . Applied Microbiology and Biotechnology, v. 101, n. 7, p. 2893-2903, . (11/02169-7, 08/58037-9, 12/20549-4, 14/18714-2)
HAHN SCHNEIDER, WILLIAN DANIEL; GONCALVES, THIAGO AUGUSTO; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI; DOS REIS, LAISA; FONTANA, ROSELEI CLAUDETE; SQUINA, FABIO MARCIO; PINHEIRO DILLON, ALDO JOSE; CAMASSOLA, MARLI. . Process Biochemistry, v. 66, p. 162-170, . (08/58037-9)
FRANCO CAIRO, JOAO P. L.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; LEONARDO, FLAVIA C.; MOFATTO, LUCIANA S.; BRENELLI, LIVIA B.; GONCALVES, THIAGO A.; UCHIMA, CRISTIANE A.; DOMINGUES, ROMANIA R.; ALVAREZ, THABATA M.; TRAMONTINA, ROBSON; et al. . FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 7, . (15/06971-3, 06/59086-8, 14/20576-7, 14/50371-8, 12/19040-0, 14/10351-8, 11/20977-3, 13/03061-0, 10/11469-1, 08/50114-4, 08/58037-9)
CONTESINI, FABIANO JARES; LIBERATO, MARCELO VIZONA; RUBIO, MARCELO VENTURA; CALZADO, FELIPE; ZUBIETA, MARIANE PALUDETTI; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; SQUINA, FABIO MARCIO; BRACHT, FABRICIO; SKAF, MUNIR S.; DAMASIO, ANDRE RICARDO. . BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1865, n. 12, p. 1758-1769, . (13/08293-7, 12/20549-4, 14/04105-4, 14/15403-6, 13/24988-5, 14/23051-2, 08/58037-9)
SQUINA, FABIO MARCIO; PRADE, ROLF ALEXANDER; WANG, HONGLIANG; MURAKAMI, MARIO TYAGO. . ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 65, p. 4-pg., . (08/58037-9)
PIMENTEL, AGNES C.; EMATSU, GABRIELA C. G.; LIBERATO, MARCELO V.; PAIXAO, DOUGLAS A. A.; FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; MANDELLI, FERNANDA; TRAMONTINA, ROBSON; GANDIN, CESAR A.; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; SQUINA, FABIO M.; et al. . International Journal of Biological Macromolecules, v. 99, p. 384-393, . (14/06923-6, 14/04105-4, 16/01926-2, 10/11469-1, 14/12861-3, 08/58037-9)
ALVAREZ, THABATA MARIA; LIBERATO, MARCELO VIZONA; FRANCO CAIRO, JOO PAULO L.; PAIXO, DOUGLAS A. A.; CAMPOS, BRUNA M.; FERREIRA, MARCEL R.; ALMEIDA, RODRIGO F.; PEREIRA, ISABELA O.; BERNARDES, AMANDA; EMATSU, GABRIELA C. G.; et al. . Applied Biochemistry and Biotechnology, v. 177, n. 2, p. 304-317, . (08/58037-9, 10/11469-1)
MANDELLI, F.; BRENELLI, L. B.; ALMEIDA, R. F.; GOLDBECK, R.; WOLF, L. D.; HOFFMAM, Z. B.; RULLER, R.; ROCHA, G. J. M.; MERCADANTE, A. Z.; SQUINA, F. M.. . INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS, v. 52, p. 770-775, . (13/03061-0, 08/58037-9, 11/14200-6, 12/18859-5)
DIOGO, JOSE A.; HOFFMAM, ZAIRA B.; ZANPHORLIN, LETICIA M.; COTA, JUNIO; MACHADO, CARLA B.; WOLF, LUCIA D.; SQUINA, FABIO; DAMASIO, ANDRE R. L.; MURAKAMI, MARIO T.; RULLER, ROBERTO. . Enzyme and Microbial Technology, v. 69, p. 31-37, . (11/14200-6, 13/10443-7, 08/58037-9)
DAMASIO, ANDRE R. L.; RUBIO, MARCELO V.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; SEGATO, FERNANDO; DIAS, BRUNO A.; CITADINI, ANA P.; PAIXAO, DOUGLAS A.; SQUINA, FABIO M.. . Biotechnology and Bioengineering, v. 111, n. 8, p. 1494-1505, . (11/13242-7, 08/58037-9, 12/12859-3)
HOFFMAM, ZAIRA B.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA M.; DIOGO, JOS A.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; CITADINI, ANA PAULA S.; LEITE, VITOR B. P.; SQUINA, FABIO M.; MURAKAMI, MARIO T.; et al. . MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, v. 55, n. 3, p. 260-267, . (10/51890-8, 11/14200-6, 11/13242-7, 08/58037-9, 11/17658-3)
DAMASIO, ANDRE R. L.; PINTO BRAGA, CLEITON MARCIO; BRENELLI, LIVIA B.; CITADINI, ANA PAULA; MANDELLI, FERNANDA; COTA, JUNIO; DE ALMEIDA, RODRIGO FERREIRA; SALVADOR, VICTOR HUGO; ALVAREDO PAIXAO, DOUGLAS ANTONIO; SEGATO, FERNANDO; et al. . Applied Microbiology and Biotechnology, v. 97, n. 15, p. 6759-6767, . (11/02169-7, 09/17956-4, 08/58037-9)
COTA, JUNIO; OLIVEIRA, LEANDRO C.; DAMASIO, ANDRE R. L.; CITADINI, ANA P.; HOFFMAM, ZAIRA B.; ALVAREZ, THABATA M.; CODIMA, CARLA A.; LEITE, VITOR B. P.; PASTORE, GLAUCIA; DE OLIVEIRA-NETO, MARIO; et al. . BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1834, n. 8, p. 1492-1500, . (11/13242-7, 11/02169-7, 08/58037-9)
GOLDBECK, ROSANA; DAMASIO, ANDRE R. L.; GONCALVES, THIAGO A.; MACHADO, CARLA B.; PAIXAO, DOUGLAS A. A.; WOLF, LUCIA D.; MANDELLI, FERNANDA; ROCHA, GEORGE J. M.; RULLER, ROBERTO; SQUINA, FABIO M.. . Applied Microbiology and Biotechnology, v. 98, n. 20, p. 8513-8525, . (13/18910-3, 08/58037-9, 12/18859-5)
SEGATO, FERNANDO; DAMASIO, ANDRE R. L.; DE LUCAS, ROSYMAR C.; SQUINA, FABIO M.; PRADE, ROLF A.. . MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS, v. 78, n. 4, p. 588-613, . (13/18910-3, 12/20549-4, 08/58037-9, 10/18198-3)
ALVAREZ, THABATA M.; GOLDBECK, ROSANA; DOS SANTOS, CAMILA RAMOS; PAIXAO, DOUGLAS A. A.; GONCALVES, THIAGO A.; FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; ALMEIDA, RODRIGO FERREIRA; PEREIRA, ISABELA DE OLIVEIRA; JACKSON, GEORGE; COTA, JUNIO; et al. . PLoS One, v. 8, n. 7, . (11/20977-3, 08/58037-9, 10/11469-1)
FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; LEONARDO, FLAVIA C.; ALVAREZ, THABATA M.; RIBEIRO, DANIELA A.; BUECHLI, FERNANDA; COSTA-LEONARDO, ANA M.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; COSTA, FERNANDO F.; PAES LEME, ADRIANA F.; PEREIRA, GONCALO A. G.; et al. . BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 4, . (08/50114-4, 06/59086-8, 08/58037-9, 10/11469-1)
TRAMONTINA, ROBSON; FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; LIBERATO, MARCELO V.; MANDELLI, FERNANDA; SOUSA, AMANDA; SANTOS, SAMANTHA; RABELO, SARITA CANDIDA; CAMPOS, BRUNA; IENCZAK, JACIANE; RULLER, ROBERTO; et al. . BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 10, . (13/06336-0, 12/20549-4, 14/20576-7, 14/04105-4, 08/58037-9)
HAHN SCHNEIDER, WILLIAN DANIEL; GONCALVES, THIAGO AUGUSTO; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI; COUGER, MATTHEW BRIAN; PRADE, ROLF; SQUINA, FABIO MARCIO; PINHEIRO DILLON, ALDO JOSE; CAMASSOLA, MARLI. . BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 9, . (14/06923-6, 08/58037-9, 12/19040-0)
CAMPOS, BRUNA MEDEIA; LIBERATO, MARCELO VIZONA; ALVAREZ, THABATA MARIA; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; EMATSU, GABRIELA CRISTINA; BARUD, HERNANE; POLIKARPOV, IGOR; RULLER, ROBERTO; GILBERT, HARRY J.; DE MATTOS ZERI, ANA CAROLINA; et al. . Journal of Biological Chemistry, v. 291, n. 45, p. 23734-23743, . (13/06336-0, 08/58037-9, 14/04105-4, 10/11469-1)

Patente(s) depositada(s) como resultado deste projeto de pesquisa

COMPOSIÇÃO DE ENZIMAS LIGNOCELULOLÍTICAS, MÉTODO DE CONVERSÃO ENZIMÁTICA E VETOR DE EXPRESSÃO DE UMA SUPERÓXIDO DISMUTASE BR 10 2015 017256 7 - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) ; Universidade Estadual de Campinas Unicamp ; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (Unesp) . Falsarella Carazzole; Fernanda Mandelli; Jose Geraldo Da Cruz Pradella; Thabata Maria Alvarez; Flávia Costa Leonardo; Fernando Ferreira Costa; Ana Maria Costa Leonardo; Robson Tramontina; Livia Beatriz Brenelli De Paiva; Thiago Augusto Gonçalves; Diogo Robl - 01 de janeiro de 2015

COMPOSIÇÃO DE ENZIMAS LIGNOCELULOLÍTICAS, MÉTODO DE CONVERSÃO ENZIMÁTICA E VETOR DE EXPRESSÃO DE UMA SUPERÓXIDO DISMUTASE PCT/BR2016/000069 - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) ; Universidade Estadual de Campinas Unicamp ; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (Unesp) . Gonçalo Amarante Guimarães Pereira; João Paulo Lourenço Cairo; Fábio Marcio Squina; Marcelo Falsarella Carazzole; Fernanda Mandelli; José Geraldo Da Cruz Pradella; Thabata Maria Alvares; Flávia Costa Leonardo; Fernando Ferreira Costa; Ana Maria Costa Leonardo; Robson Tramontina; Livia Beatriz Brenelli De Paiva; Thiago Augusto Gonçalves; Diogo Robl - 01 de janeiro de 2016