Estudo de associação de variantes raras em genes candidatos à fissuras orofaciais na população brasileira

• Processo: 16/17392-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
• Beneficiário: Ágatha Cristhina Oliveira Faria
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco, AP.CEPID
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Fenda labial Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Doenças Complexas | fissuras labiopalatinas | Herdabilidade perdida | sequenciamento de nova geração | Genômica

Resumo

As fissuras orofaciais (FO), que incluem fissuras de lábio com ou sem acometimento de palato (FL/P) e as fissuras apenas de palato (FP), são o tipo de malformação congênita craniofacial mais comum. As FO não sindrômicas (FO-NS) correspondem a 70% de todos os casos de FO, possuem etiologia complexa e pouco compreendida, sendo consideradas de herança multifatorial com forte influência de fatores genéticos e ambientais. Apesar de estudos de análise de ligação e associação apontarem vários loci de susceptibilidade à FO-NS, o componente genético ainda não está totalmente explicado. O avanço nas tecnologias de sequenciamento de nova geração permitiu a detecção de um maior número de variantes raras e mudou o foco dos estudos de associação de doenças complexas. Cresceu o número de estudos sugerindo que variantes raras podem explicar parte da herdabilidade perdida de muitas doenças multifatoriais, incluindo as FO. Desta forma, o objetivo deste projeto é identificar a contribuição de variantes raras na etiologia das FO-NS. Para isso, serão sequenciados 68 genes candidatos em pelo menos 200 pacientes com FO-NS familial utilizando sequenciamento de nova geração. As variantes raras encontradas serão validadas pelo método de Sequenciamento de Sanger e comparadas com variantes em bancos de dados públicos e em uma amostra de 609 indivíduos brasileiros não afetados.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SAMOGY-COSTA, CLAUDIA ISMANIA; VARELLA-BRANCO, ELISA; MONFARDINI, FREDERICO; FERRAZ, HELEN; FOCK, RODRIGO AMBROSIO; ALMEIDA BARBOSA, RICARDO HENRIQUE; SANTOS PESSOA, ANDRE LUIZ; ALVAREZ PEREZ, ANA BEATRIZ; LOURENCO, NAILA; VIBRANOVSKI, MARIA; et al. A Brazilian cohort of individuals with Phelan-McDermid syndrome: genotype-phenotype correlation and identification of an atypical case. JOURNAL OF NEURODEVELOPMENTAL DISORDERS, v. 11, JUL 18 2019. (16/17392-7, 13/08028-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FARIA, Ágatha Cristhina Oliveira. Fatores de susceptibilidade às fissuras orofaciais. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.