Investigação de perfis microbianos humanos e sua relação com o câncer

Resumo

Na espécie humana, a quantidade de células microbianas é 10 vezes maior que as próprias células humanas. Hoje sabemos que esse nosso metagenoma influencia diversos processos, tais como o metabolismo, o desenvolvimento dos tecidos, a inflamação e imunidade. Certos locais do corpo humano possuem um contato maior com o ambiente externo, tornando o papel que o microbioma possui, mais proeminente. O estudo dos perfis microbianos destes locais pode colaborar com um conhecimento maior sobre sua relação no desenvolvimento de doenças causadas por agentes infeciosos, inclusive o câncer, pois estima-se que eles tenham um papel central em cerca de 20% de todas as neoplasias. Para avaliar a relação bacterioma:câncer iremos: 1) caracterizar a diversidade bacteriana existente em amostras de suco gástrico de indivíduos com lesões pré-neoplásicas (n=30) ou com câncer gástrico (n=40), comparados a indivíduos sem alterações clínicas relevantes (n=30); 2) caracterizar a diversidade bacteriana existente em amostras de biópsias de indivíduos com adenocarcinomas retais (n=18), comparados a biópsias de indivíduos livres de alterações clínicas relevantes (n=18); e 3) avaliar temporalmente a diversidade bacteriana em biópsias de indivíduos com tumores colorretais antes e após radioterapia (n= 40) em 3 intervalos de tempo diferentes, a fim de determinar se perturbações bacterianas possuem uma relação com o desenvolvimento da retite actínica. Para tanto, iremos usar uma abordagem multidisciplinar que irá englobar aspectos de genômica, como o sequenciamento de nova geração do gene 16S rRNA bacteriano, e aspectos avançados de bioinformática para analisar os resultados do sequenciamento. Concomitantemente, iremos minerar bancos de dados públicos usando um pipeline bioinformático afim de investigar a presença de DNA ou RNA bacteriano, buscando validar os achados do sequenciamento de nova geração. (AU)