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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

TET Upregulation Leads to 5-Hydroxymethylation Enrichment in Hepatoblastoma

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Autor(es):
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Rivas, Maria Prates [1] ; Marques Aguiar, Talita Ferreira [2, 1] ; Fernandes, Gustavo Ribeiro [3] ; Caires, Luiz Carlos [1] ; Goulart, Ernesto [1] ; Telles-Silva, Kayque Alves [1] ; Cypriano, Monica [4] ; Caminada de Toledo, Silvia Regina [4] ; Rosenberg, Carla [1] ; Carraro, Dirce Maria [2] ; Lima da Costa, Cecilia Maria [5] ; da Cunha, Isabela Werneck [6] ; Victorino Krepischi, Ana Cristina [1]
Número total de Autores: 13
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Inst Biosci, Dept Genet & Evolutionary Biol, Human Genome & Stem Cell Res Ctr, Sao Paulo - Brazil
[2] AC Camargo Canc Ctr, Int Ctr Res, Sao Paulo - Brazil
[3] Univ Sao Paulo, Dept Biochem Inst Chem, Sao Paulo - Brazil
[4] Univ Fed Sao Paulo, Dept Pediat Support Grp Children & Adolescents Ca, Sao Paulo - Brazil
[5] AC Camargo Canc Ctr, Dept Pediat Oncol, Sao Paulo - Brazil
[6] Rede Dor Sao Luiz, Dept Pathol, Sao Paulo - Brazil
Número total de Afiliações: 6
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: FRONTIERS IN GENETICS; v. 10, JUN 12 2019.
Citações Web of Science: 1
Resumo

Hepatoblastoma is an embryonal liver tumor carrying few genetic alterations. We previously disclosed in hepatoblastomas a genome-wide methylation dysfunction, characterized by hypermethylation at specific CpG islands, in addition to a low-level hypomethylation pattern in non-repetitive intergenic sequences, in comparison to non-tumoral liver tissues, shedding light into a crucial role for epigenetic dysregulation in this type of cancer. To explore the underlying mechanisms possibly related to aberrant epigenetic modifications, we evaluated the expression profile of a set of genes engaged in the epigenetic machinery related to DNA methylation (DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, DNMT3L, UHRF1, TET1, TET2, and TET3), as well as the 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) global level. We observed in hepatoblastomas a general disrupted expression of these genes from the epigenetic machinery, mainly UHRF1, TET1, and TET2 upregulation, in association with an enrichment of 5hmC content. Our findings support a model of active demethylation by TETs in hepatoblastoma, probably during early stages of liver development, which in combination with UHRF1 overexpression would lead to DNA hypomethylation and an increase in overall 5hmC content. Furthermore, our data suggest that decreased 5hmC content might be associated with poor survival rate, highlighting a pivotal role of epigenetics in hepatoblastoma development and progression. (AU)

Processo FAPESP: 16/23462-8 - Estudo de mecanismos epigenéticos em tumores de fígado: modulação da expressão de genes reguladores da epigenética e análise de expressão gênica por RNAseq em hepatoblastoma.
Beneficiário:Maria Prates Rivas
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco
Beneficiário:Mayana Zatz
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
Processo FAPESP: 17/16283-2 - Desenvolvimento de técnicas de bioengenharia de tecidos para a reconstrução funcional, ex vivo, de fígados, a partir de células iPSCs
Beneficiário:Luiz Carlos de Caires Júnior
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 15/14821-1 - Desenvolvimento de by-pass vascular hepático funcionalizado com células humanas derivadas de iPSCs
Beneficiário:Ernesto da Silveira Goulart Guimarães
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 16/04785-0 - Estudo de mutações somáticas identificadas em sequenciamento de exoma de hepatoblastoma
Beneficiário:Talita Ferreira Marques Aguiar
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto