The study of clinical isolates fungi and the metagenomics of the lung microbiome of patients with fibrosis cystic

• Grant number: 19/08383-2
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: June 01, 2019
• End date: July 31, 2020
• Field of knowledge: Biological Sciences - Microbiology - Biology and Physiology of Microorganisms
• Principal Investigator: Marcia Regina von Zeska Kress
• Grantee: Patrícia Helena Grizante Barião
• Host Institution: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brazil
• Associated research grant: 17/25300-8 - Study of fungal clinical isolates from different anatomical sites and metagenomic of the lung microbiome of patients with cystic fibrosis, AP.R

Abstract

Os microrganimos e seu equilíbrio no corpo humano são necessários para manter um indivíduo saudável. Uma vez que este equilíbrio é rompido, ocorre o crescimento excessivo de agentes patogênicos. Diversos fatores levam a este desequilíbrio, um deles é pela mutação no gene do Regulador de Condutância Transmembrana da Fibrose Cística que causa a interrupção da transferência normal dos íons cloro e sódio através das membranas celulares que levam a desidratação e consequentemente aumento da viscosidade das secreções celulares, que pode ocasionar falência do clearance mucociliar pulmonar de pacientes com Fibrose Cística (FC). O estudo dos microbiomas vem sendo facilitado pela tecnologia do sequenciamento de nova geração, capaz de inclusive sequenciar material genético de microrganismos não cultiváveis. O presente projeto tem por objetivo estudar isolados clínicos fúngicos e a metagenômica por amplicons e shotgun do microbioma (bactérias e fungos) do pulmão de pacientes com fibrose cística. Serão principalmente estudados os isolados clínicos dos fungos filamentosos patogênicos dos gêneros Aspergillus e Fusarium. A identificação molecular pelo estudo do seu material genético, sensibilidade a antifúngicos, virulência em modelo experimental Galleria mellonella trarão informação importantes quanto ao perfil destes microrganismos fúngicos causadores de infecção. Os resultados aqui obtidos possibilitarão uma visão crítica e auxiliarão na tomada de decisão clínica sobre a melhor abordagem terapêutica.