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Agma Juci Machado Traina

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC)  (Institutional affiliation for the last research proposal)
Birthplace: Brazil

She has a Bachelor degree in Computer Science from the ICMSC-USP (1983), a Master degree in Computer Science and Computational Mathematics from the ICMSC-USP (1987), and a PhD in Computational Applied Physics from the IFQSC-USP (1991). She also spent a sabbatical leave at the Carnegie Mellon University (1998-2000) working on Multimedia Databases. She has been a Full Professor with the Department of Computer Science at ICMC-USP since 2008. She participated in and coordinated several national and international projects, integrating multidisciplinary teams of researchers and students. She has published more than 250 papers in selective journals and conferences, where she has received several awards for best paper, as well as mentored more than 50 graduate students. She participates in several editorial committees of journals and steering committees of conferences in her field. Her research interests include indexing and retrieval of complex data by content, similarity queries, data visualization, visual data mining, as well as image and video processing. Agma has been working in the integration of the results of her research lines with applications for the areas of medicine and agro-climatology, aiming at the development of applied computational systems. (Source: Lattes Curriculum)

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FAPESP support in numbers * Updated February 22, 2020
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Keywords used by the researcher
Videos related to Research Grants and Scholarships

Managing Complex Big Databases to Support Decision Making in Health Systems

Published in November 26, 2019 - FAPESP NewsAgency. Technical Session 5: Data Science & Machine Learning for Complex and Dynamical Models. Managing Complex Big Databases to Support Decision Making in Health Systems. One of the biggest challenges posed to the computer science field is integrating, organizing, and taking advantage of very large volumes of multi-modal data from diversified platforms for boosting decision-making processes. That is, how is it possible to use data from a variety of sources (patient’s exams, monitoring and treatment) to gather information from similar cases and build a better understanding of the case under analysis? Moreover, many times the data are not complete but cannot be discharged, as in the usual approach. In this talk, I will briefly discuss challenges and ongoing researches at the University of Sao Paulo that deal with such challenges in the context of health systems.
Scientific publications resulting from Research Grants and Scholarships under the grantee's responsibility (17)

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

Publications13
Citations19
Cit./Article1.5
Data from Web of Science

SPADON, GABRIEL; BRANDOLI, BRUNO; ELER, DANILO M.; RODRIGUES-, JR., JOSE F.. Detecting multi-scale distance-based inconsistencies in cities through complex-networks. JOURNAL OF COMPUTATIONAL SCIENCE, v. 30, p. 209-222, . Web of Science Citations: 1. (16/17078-0, 17/08376-0, 16/02557-0)

CAZZOLATO, MIRELA T.; SCABORA, LUCAS C.; NESSO-JR, MARCOS R.; MILANO-OLIVEIRA, LUIS F.; COSTA, ALCEU F.; KASTER, DANIEL S.; KOENIGKAM-SANTOS, MARCEL; DE AZEVEDO-MARQUES, PAULO MAZZONCINI; TRAINA-JR, CAETANO; TRAINA, AGMA J. M.. dp-BREATH: Heat maps and probabilistic classification assisting the analysis of abnormal lung regions. COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, v. 173, p. 27-34, . Web of Science Citations: 2. (18/24414-2, 16/17078-0, 16/17330-1)

FERREIRA-JUNIOR, JOSE RANIERY; KOENIGKAM-SANTOS, MARCEL; MAGALHAES TENORIO, ARIANE PRISCILLA; FALEIROS, MATHEUS CALIL; GARCIA CIPRIANO, FEDERICO ENRIQUE; FABRO, ALEXANDRE TODOROVIC; NAPPI, JANNE; YOSHIDA, HIROYUKI; DE AZEVEDO-MARQUES, PAULO MAZZONCINI. CT-based radiomics for prediction of histologic subtype and metastatic disease in primary malignant lung neoplasms. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY, . Web of Science Citations: 0. (16/17078-0, 14/50889-7)

FELIPE, JOAQUIM CEZAR; TRAINA, JR., CAETANO; MACHADO TRAINA, AGMA JUCI. A New Family of Distance Functions for Perceptual Similarity Retrieval of Medical Images. JOURNAL OF DIGITAL IMAGING, v. 22, n. 2, p. 183-201, . Web of Science Citations: 8.

BUENO‚ R.; TRAINA‚ A.J.M.; TRAINA‚ C.. Genetic algorithms for approximate similarity queries. DATA & KNOWLEDGE ENGINEERING, v. 62, n. 3, p. 459-482, .

BRINIS, SAFIA; TRAINA, JR., CAETANO; TRAINA, AGMA J. M.. Hollow-tree: a metric access method for data with missing values. JOURNAL OF INTELLIGENT INFORMATION SYSTEMS, v. 53, n. 3, SI, p. 481-508, . Web of Science Citations: 0. (16/17078-0)

GIUNTINI, FELIPE T.; CAZZOLATO, MIRELA T.; DOS REIS, MARIA DE JESUS DUTRA; CAMPBELL, ANDREW T.; TRAINA, AGMA J. M.; UEYAMA, JO. A review on recognizing depression in social networks: challenges and opportunities. JOURNAL OF AMBIENT INTELLIGENCE AND HUMANIZED COMPUTING, . Web of Science Citations: 0. (16/17078-0, 18/24414-2, 13/07375-0, 18/17335-9)

DE SOUSA‚ E.P.M.; TRAINA‚ A.J.M.; TRAINA‚ C.; FALOUTSOS‚ C.. Measuring evolving data streams’ behavior through their intrinsic dimension. NEW GENERATION COMPUTING, v. 25, n. 1, p. 33-60, . (05/04272-9)

BALAN, ANDRE G. R.; TRAINA, AGMA J. M.; RIBEIRO, MARCELA X.; MARQUES, PAULO M. A.; TRAINA, JR., CAETANO. Smart histogram analysis applied to the skull-stripping problem in T1-weighted MRI. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, v. 42, n. 5, p. 509-522, . Web of Science Citations: 3. (07/50285-0, 05/04272-9)

ARANTES, ADRIANO SIQUEIRA; VIEIRA, MARCOS R.; TRAINA JUNIOR, CAETANO; TRAINA, AGMA J. M.. Efficient algorithms to execute complex similarity queries in RDBMS. Journal of the Brazilian Computer Society, v. 9, n. 3, p. 5-24, .

BLANCO, GUSTAVO; TRAINA, AGMA J. M.; TRAINA JR, CAETANO; AZEVEDO-MARQUES, PAULO M.; JORGE, ANA E. S.; DE OLIVEIRA, DANIEL; BEDO, MARCOS V. N.. A superpixel-driven deep learning approach for the analysis of dermatological wounds. COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, v. 183, . Web of Science Citations: 0. (16/17078-0)

OLIVEIRA, PAULO H.; SCABORA, LUCAS C.; CAZZOLATO, MIRELA T.; OLIVEIRA, WILLIAN D.; PAIXAO, RAFAEL S.; TRAINA, AGMA J. M.; TRAINA, CAETANO. Employing Domain Indexes to Efficiently Query Medical Data From Multiple Repositories. IEEE JOURNAL OF BIOMEDICAL AND HEALTH INFORMATICS, v. 23, n. 6, p. 2220-2229, . Web of Science Citations: 1. (16/17078-0, 15/15392-7, 16/17330-1)

FELIPE, JOAQUIM CEZAR; TRAINA, JR., CAETANO; MACHADO TRAINA, AGMA JUCI. A New Family of Distance Functions for Perceptual Similarity Retrieval of Medical Images. JOURNAL OF DIGITAL IMAGING, v. 22, n. 2, p. 183-201, . Web of Science Citations: 8.

BUENO‚ R.; TRAINA‚ A.J.M.; TRAINA‚ C.. Genetic algorithms for approximate similarity queries. DATA & KNOWLEDGE ENGINEERING, v. 62, n. 3, p. 459-482, .

CAZZOLATO, MIRELA T.; SCABORA, LUCAS C.; NESSO-JR, MARCOS R.; MILANO-OLIVEIRA, LUIS F.; COSTA, ALCEU F.; KASTER, DANIEL S.; KOENIGKAM-SANTOS, MARCEL; DE AZEVEDO-MARQUES, PAULO MAZZONCINI; TRAINA-JR, CAETANO; TRAINA, AGMA J. M.. dp-BREATH: Heat maps and probabilistic classification assisting the analysis of abnormal lung regions. COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, v. 173, p. 27-34, . Web of Science Citations: 2. (18/24414-2, 16/17078-0, 16/17330-1)

FERREIRA-JUNIOR, JOSE RANIERY; KOENIGKAM-SANTOS, MARCEL; MAGALHAES TENORIO, ARIANE PRISCILLA; FALEIROS, MATHEUS CALIL; GARCIA CIPRIANO, FEDERICO ENRIQUE; FABRO, ALEXANDRE TODOROVIC; NAPPI, JANNE; YOSHIDA, HIROYUKI; DE AZEVEDO-MARQUES, PAULO MAZZONCINI. CT-based radiomics for prediction of histologic subtype and metastatic disease in primary malignant lung neoplasms. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY, . Web of Science Citations: 0. (16/17078-0, 14/50889-7)

SPADON, GABRIEL; BRANDOLI, BRUNO; ELER, DANILO M.; RODRIGUES-, JR., JOSE F.. Detecting multi-scale distance-based inconsistencies in cities through complex-networks. JOURNAL OF COMPUTATIONAL SCIENCE, v. 30, p. 209-222, . Web of Science Citations: 1. (16/17078-0, 17/08376-0, 16/02557-0)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

COSTA, Alceu Ferraz. Mineração de Dados de Atividade de Usuários em Serviços de Mídia Social. 2017. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

BUGATTI, Pedro Henrique. Arcabouço para recuperação de imagens por conteúdo visando à percepção do usuário. 2012. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

SILVA, Marcelo Ponciano da. Processamento de consultas por similaridade em imagens médicas visando à recuperação perceptual guiada pelo usuário. 2009. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

SILVA, Sergio Francisco da. Seleção de características por meio de algoritmos genéticos para aprimoramento de rankings e de modelos de classificação. 2011. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

COSTA, Alceu Ferraz. Mineração de imagens médicas utilizando características de forma. 2012. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

AVALHAIS, Letrícia Pereira Soares. Transformação de espaços métricos otimizando a recuperação de imagens por conteúdo e avaliação por análise visual. 2012. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

SOUZA, Jessica Andressa de. Agrupamento de dados complexos para apoiar consultas por similaridade com tratamento de restrições. 2018. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

COLTURATO, Danielle Bentivoglio. Ambiente interativo para visualização de dados de neurônios. 2001. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

PEDROSA, Glauco Vitor. Caracterização e recuperação de imagens usando dicionários visuais semanticamente enriquecidos. 2015. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

CHINO, Daniel Yoshinobu Takada. Mineração de padrões frequentes em séries temporais para apoio à tomada de decisão em agrometereologia. 2014. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

BUENO, Josiane Maria. Suporte à recuperação de imagens médicas baseadas em conteúdo através de Histogramas Métricos.. 2002. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

JÚNIOR, José Fernando Rodrigues. "Desenvolvimento de um Framework para Análise Visual de Informações Suportando Data Mining". 2003. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

CHINO, Fabio Jun Takada. "Visualizando a organização e o comportamento de estruturas métricas: aplicações em consultas por similaridade". 2004. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

BALAN, André Guilherme Ribeiro. Métodos adaptativos de segmentação aplicados à recuperação de imagens por conteúdo. 2007. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

JÚNIOR, José Fernando Rodrigues. Design espacial-perceptivo: uma nova compreensão para representações visuais interativas. 2007. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

BUGATTI, Pedro Henrique. Análise da influência de funções de distância para o processamento de consultas por similaridade em recuperação de imagens por conteúdo. 2008. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

RIBEIRO, Marcela Xavier. Suporte a sistemas de auxílio ao diagnóstico e de recuperação de imagens por conteúdo usando mineração de regras de associação. 2008. Tese (Doutorado) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos.

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