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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

RNA interference may result in unexpected phenotypes in Caenorhabditis elegans

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Autor(es):
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De-Souza, Evandro A. [1, 2] ; Camara, Henrique [3, 4, 1] ; Salgueiro, Willian G. [3, 4] ; Moro, Raissa P. [3, 4] ; Knittel, Thiago L. [3, 4] ; Tonon, Guilherme [3, 4] ; Pinto, Silas [3, 4, 1] ; Pinca, Ana Paula F. [1] ; Antebi, Adam [5, 6] ; Pasquinelli, Amy E. [7] ; Massirer, Katlin B. [4, 8, 9] ; Mori, Marcelo A. [3, 4, 1]
Número total de Autores: 12
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Fed Sao Paulo, Program Mol Biol, BR-04044020 Sao Paulo - Brazil
[2] Univ Fed Rio de Janeiro, Inst Bioquim Med Leopoldo de Meis, Program Mol Biol & Biotechnol, BR-21941902 Rio De Janeiro - Brazil
[3] Univ Estadual Campinas, Dept Biochem & Tissue Biol, BR-13083862 Campinas, SP - Brazil
[4] Univ Estadual Campinas, Program Genet & Mol Biol, BR-13083970 Campinas, SP - Brazil
[5] Max Planck Inst Biol Ageing, D-50931 Cologne - Germany
[6] Univ Cologne, Cologne Excellence Cluster Cellular Stress Respon, D-50931 Cologne - Germany
[7] Univ Calif San Diego, Div Biol, La Jolla, CA 92093 - USA
[8] Univ Estadual Campinas, CBMEG UNICAMP, Ctr Mol Biol & Genet Engn, BR-13083875 Campinas, SP - Brazil
[9] Univ Estadual Campinas, Struct Genom Consortium UNICAMP, BR-13083875 Campinas, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 9
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Nucleic Acids Research; v. 47, n. 8, p. 3957-3969, MAY 7 2019.
Citações Web of Science: 3
Resumo

RNA interference (RNAi) is a valuable technique to determine gene function. In Caenorhabditis elegans, RNAi can be achieved by feeding worms bacteria carrying a plasmid expressing double-stranded RNA (dsRNA) targeting a gene of interest. The most commonly used plasmid vector for this purpose is L4440. However, it has been noticed that sequences within L4440 may elicit unspecific effects. Here, we provide a comprehensive characterization of these effects and their mechanisms and describe new unexpected phenotypes uncovered by the administration of unspecific exogenous dsRNA. An example involves dsRNA produced by the multiple cloning site (MCS) of L4440, which shares complementary sequences with some widely used reporter vectors and induces partial transgene silencing via the canonical and antiviral RNAi pathway. Going beyond transgene silencing, we found that the reduced embryonic viability of mir-35-41(gk262) mutants is partially reversed by exogenous dsRNA via a mechanism that involves canonical RNAi. These results indicate cross-regulation between different small RNA pathways in C. elegans to regulate embryonic viability. Recognition of the possible unspecific effects elicited by RNAi vectors is important for rigorous interpretation of results from RNAi-based experiments. (AU)

Processo FAPESP: 17/22057-5 - Estudo dos efeitos fisiológicos e da herança transgeracional induzida por dieta rica em colesterol em Caenorhabditis elegans
Beneficiário:Willian Goulart Salgueiro
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 14/10814-8 - Determinação de fatores que controlam a expressão de Dicer in vivo em C. elegans
Beneficiário:Evandro Araújo de Souza
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 17/08829-5 - Investigação da interação de Dicer com a via de sinalização de NAD+ no contexto do metabolismo e do envelhecimento em C. elegans
Beneficiário:Guilherme Tonon da Silva
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 17/01184-9 - CAMeLEOm: análise entre espécies dos efeitos metabólicos, na expectativa de vida e ômicas de miméticos de restrição dietética
Beneficiário:Marcelo Alves da Silva Mori
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 15/01316-7 - Dicer, miRNAs e o controle da função mitocondrial no contexto do envelhecimento e da restrição calórica
Beneficiário:Marcelo Alves da Silva Mori
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 14/25068-0 - Desvendando novos mecanismos responsáveis pelo controle não-autônomo da proteostase celular em c. elegans
Beneficiário:Ana Paula Forti Pinca
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 17/01339-2 - Desvendando Mecanismos de Controle da Longevidade por RNAs Móveis
Beneficiário:Henrique Camara
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 17/03423-0 - Caracterização de Alterações Proteicas Tecido-Específicas com o Envelhecimento e a Restrição Calórica em C. Elegans
Beneficiário:Thiago Leite Knittel
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 12/00195-3 - Redes de regulação pós-transcricional por proteínas de ligação a RNA em células tronco embrionárias humanas
Beneficiário:Katlin Brauer Massirer
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 16/02207-0 - Identificação de interações soma-linhagem germinativa que possam afetar a longevidade em Caenorhabditis elegans
Beneficiário:Evandro Araújo de Souza
Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
Processo FAPESP: 10/52557-0 - Identificação de mecanismos responsáveis pelos efeitos benéficos da restrição calórica
Beneficiário:Marcelo Alves da Silva Mori
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 16/15958-3 - Interação Soma-Linhagem germinativa na longevidade: o papel de argonautas no envelhecimento de c. elegans
Beneficiário:Raíssa de Paula Moro
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 17/04377-2 - Estudo dos efeitos de Dicer sobre a função mitocondrial, o metabolismo e o envelhecimento em nematóides c. elegans
Beneficiário:Silas Pinto da Silva
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado