Comparative genomic analysis of avian and human extra-intestinal Escherichia coli strains

• Grant number: 13/25615-8
• Support type: Scholarships abroad - Research Internship - Post-doctor
• Effective date (Start): April 01, 2014
• Effective date (End): March 31, 2015
• Field of knowledge: Agronomical Sciences - Veterinary Medicine - Preventive Veterinary Medicine
• Principal researcher: Wanderley Dias da Silveira
• Grantee: Renato Pariz Maluta
• Supervisor abroad: Lisa Kay Nolan
• Home Institution: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brazil
• Research place: Iowa State University, United States
• Associated to the scholarship: 12/05073-3 - MOLECULAR CHARACTERIZATION OF AVIAN PATHOGENIC (APEC) AND HUMAN UROPATHOGENIC (UPEC) ESCHERICHIA COLI LINEAGES, BP.PD

Abstract

Linhagens de Escherichia coli patogênica para aves (APEC) são agentes relacionados a graus significantes de morbidade e mortalidade em frangos de corte a aves poedeiras, causando prejuízo na indústria aviária no mundo todo. Além disso, tem sido sugerido que linhagens APEC podem apresentar um papel como agentes zoonóticos. Neste projeto, nosso objetivo é montar os genomas de linhagens APEC e linhagens de Escherichia coli extra-intestinais humenas (ExPEC), as quais foram analisadas durante o projeto de Pós doutorado (FAPESP 2012/05073-3). As montagens levarão a comparações entre os genomas centrais e acessórios. As ilhas de patogenicidade (PAIs), serão detectadas in silico. A análise filogenômica será comparada com o MLST e tipagem ECOR, os quais foram realizados no contexto do projeto 2012/05073-3. As comparações entre APEC e ExPEC humanas podem demonstrar similaridades notáveis em relação à filogenia e marcas de virulência. Essas similaridades podem indicar novas características sobrepostas entre APEC e ExPEC humana, reforçando ou demonstrando o potencial zoonótico de um grupo de linhagens APEC. (AU)

Scientific publications

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

MALUTA, RENATO P.; NICHOLSON, BRYON; LOGUE, CATHERINE M.; NOLAN, LISA K.; ROJAS, THAIS C. G.; DA SILVEIRA, WANDERLEY DIAS. Complete Genomic Sequence of an Avian Pathogenic Escherichia coli Strain of Serotype O7:HNT. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 4, n. 1 JAN-FEB 2016. Web of Science Citations: 1.