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Phytochemical and chemoinformatics tools and analytical methodologies in the dereplication of extracts of medicinal plants.

Grant number: 08/05754-5
Support Opportunities:Scholarships in Brazil - Post-Doctoral
Start date: December 01, 2008
End date: August 31, 2009
Field of knowledge:Health Sciences - Pharmacy - Pharmacognosy
Principal Investigator:Fernando Batista da Costa
Grantee:Leonardo Gobbo Neto
Host Institution: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brazil

Abstract

Estudos etnofarmacológicos preliminares realizados por nosso grupo de pesquisas revelaram três plantas medicinais promissoras da família Asteraceae com potencial antiinflamatório: Smallanthus sonchifolius (yacón), Tithonia diversifolia (margaridão) e Dasyphyllum brasiliense (espinho-agulha). As partes aéreas destas espécies são utilizadas pela população na forma de chá, sendo necessária, portanto, uma investigação detalhada sobre a composição química de seus extratos com vistas ao conhecimento de seus princípios ativos. Assim, neste projeto propõe-se obter diferentes tipos de extratos, isolar e identificar diferentes classes de micromoléculas a partir destas três espécies e quantificá-las nos diferentes extratos obtidos. Os metabólitos secundários isolados serão utilizados para se elaborar uma biblioteca de substâncias puras, com vistas à informatização e obtenção de dados físico-químicos, cromatográficos e espectrométricos. Será desenvolvida uma metodologia analítica em CLAE-DAD para a comparação dos perfis metabólicos dos diferentes extratos das espécies selecionadas. A identificação de picos cromatográficos será realizada por meio de comparação de tempos de retenção com substâncias previamente isoladas e/ou por desreplicação utilizando-se CLAE-DAD-EM. A metodologia analítica será validada e empregada para elaborar um banco de dados com informações sobre as substâncias da biblioteca. Com base nos dados obtidos pela metodologia analítica, combinados com ferramentas de quimioinformática, propõe-se também obter modelos computacionais utilizando-se inteligência artificial para estudar, in silico, a relação entre estrutura química e tempos de retenção (QSRR - Quantitative Structure-Retention Relationships). Os extratos e substâncias puras serão utilizados pelo grupo para outros estudos in silico e para a realização de ensaios biológicos in vivo e in vitro em diferentes modelos. Os dados gerados no processo de identificação e estudos de QSRR, por sua vez, poderão ser utilizados para auxiliar a desreplicação de outras espécies vegetais de interesse medicinal e/ou comercial.

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Scientific publications
(The scientific publications listed on this page originate from the Web of Science or SciELO databases. Their authors have cited FAPESP grant or fellowship project numbers awarded to Principal Investigators or Fellowship Recipients, whether or not they are among the authors. This information is collected automatically and retrieved directly from those bibliometric databases.)
OLIVEIRA, TIAGO B.; GOBBO-NETO, LEONARDO; SCHMIDT, THOMAS J.; DA COSTA, FERNANDO B.. Study of Chromatographic Retention of Natural Terpenoids by Chemoinformatic Tools. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 55, n. 1, p. 26-38, . (11/17860-7, 13/14239-5, 10/51454-3, 08/05754-5)