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Transtorno do Espectro Autista: Arquitetura genética, Mecanismos patofisiológicos e Ferramentas de diagnóstico e prognóstico

Processo:24/21989-5
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2025
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2030
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
Beneficiário:Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Pesquisadores principais:
Andréa Laurato Sertié ; Helena Paula Brentani
Pesquisadores associados:Ana Cristina Victorino Krepischi ; Ariane Machado Lima ; Débora Romeo Bertola ; Diego Luiz Rovaris ; Elizabeth Shephard ; Fabio Papes ; Fátima de Lourdes dos Santos Nunes Marques ; Gerson Shigeru Kobayashi ; Guilherme Lopes Yamamoto ; Guilherme Vanoni Polanczyk ; Karina Griesi Oliveira ; Mayana Zatz
Auxílio(s) vinculado(s):26/03291-6 - Proposta Sprint Fase I: Integração de ferramentas bioinformáticas e sequenciamento de leituras longas (Long-Reads) para dissecar a arquitetura genética de condições neuropsiquiátricas, AP.R SPRINT
Bolsa(s) vinculada(s):26/23327-5 - Caracterização molecular de neurônios SHANK3 +/- expostos ao tratamento com Ouabaína, y-Benzylidene Digoxin 8, e BOUA-8., BP.DR
26/18571-4 - Idade epigenética e conectividade cerebral como biomarcadores de progressão clínica na síndrome de Phelan-McDermid., BP.PD
26/01285-9 - Caracterização de Variantes de Número de Cópias em uma Coorte Brasileira com Diagnóstico de Transtorno do Espectro Autista., BP.IC
+ mais bolsas vinculadas 25/25550-0 - Caracterização de células iPSCs e neuronais de pacientes com mutações patogênicas no gene PSEN1, BP.IC
25/28264-9 - Contribuição de variantes bialélicas para a arquitetura genética do Transtorno do Espectro Autista, BP.IC
25/26690-0 - Uso de faciometria e métodos de pontuação de variantes raras em todo o genoma para à identificação de endofenótipos clinicamente informativos, BP.TT
25/27468-0 - Geração e Caracterização de Quimeroides Corticais Humanos para Estudo de Neurodesenvolvimento e Neurodegeneração, BP.TT
25/26969-5 - Desenvolvimento de pipelines para avaliar PRSs, sua transportabilidade e integração em amostras brasileiras com TEA (N < 1000), utilizando dados públicos de Genome Wide Association Studies (GWAS), BP.DR
25/18385-3 - Caracterização do perfil de expressão celular de genes associados à apraxia de fala infantil, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Biomarcadores  Neurônios  Genômica  Epigenômica  Transtorno autístico  Células-tronco pluripotentes induzidas 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:autismo | biomarcadores | epigenética | Genômica | iPSC | neurônio | Genética e genômica funcional

Resumo

O Transtorno do Espectro Autista (TEA) é um transtorno do neurodesenvolvimento multifatorial, com prevalência mundial de 1-2%, representando um importante desafio de saúde pública. Estudos genéticos mostram a complexidade da arquitetura genética do TEA e sua relevância para entender a heterogeneidade clínica, os mecanismos patofisiológicos e para o desenvolvimento de biomarcadores para diagnóstico e terapias personalizadas. Este projeto integra três eixos complementares para investigar o TEA: (1) a arquitetura genética subjacente, (2) os mecanismos patofisiológicos das variantes genéticas e (3) a heterogeneidade clínica e das trajetórias ao longo da vida. A abordagem integrativa conecta dados genéticos, moleculares, celulares e clínicos, proporcionando uma compreensão mais profunda dos fatores que moldam o TEA. O eixo 1 foca na arquitetura genética do TEA, analisando a interação entre variantes raras e comuns e sua relação com a variabilidade fenotípica (diferenças na forma como a doença se manifesta). Será desenvolvido um pipeline para avaliar a transportabilidade de PRSs (Polygenic Risk Scores) feitos em populações diversas para a população brasileira, com foco na seleção de métricas adequadas para nossa população. Modelos de homogeneização genética e agregação familiar também serão explorados para identificar variantes que impactem a expressividade fenotípica. O eixo 2 investiga como variantes genéticas de risco afetam a composição celular do córtex cerebral em desenvolvimento, aumentando a vulnerabilidade a processos neurodegenerativos, especialmente sob influência de fatores inflamatórios. Organóides cerebrais (estruturas semelhantes a cérebros desenvolvidos a partir de células-tronco) serão gerados a partir de células-tronco pluripotentes induzidas (iPSCs) de pacientes com variantes patogênicas para estudar a predisposição a fenótipos neurodegenerativos. Além disso, organóides quiméricos, compostos por células de múltiplos doadores, serão usados para estudar a variação no desenvolvimento cerebral e na resposta a estressores ambientais. O eixo 3 busca identificar marcadores e ferramentas para aprimorar o diagnóstico e prognóstico do TEA, levando em consideração a arquitetura genética, heterogeneidade clínica e trajetórias ao longo da vida. Serão aplicadas diferentes abordagens, incluindo ferramentas computacionais e aprendizado de máquina, para integrar dados genéticos, clínicos, neurofisiológicos, e epigenéticos, criando modelos para diagnóstico, identificação de subgrupos e acompanhamento clínico. Adotando uma abordagem holística, os três eixos deste projeto visam aprofundar a compreensão da complexidade genética e fenotípica do TEA e dos seus mecanismos moleculares com a expectativa de gerar resultados aplicáveis à prática clínica e contribuir para um diagnóstico mais preciso e terapias personalizadas. (AU)

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Publicações científicas
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
SERTIE, ANDREA LAUTATO; JOSINO, RAPHAELLA; GOLL, VITORIA REZENDE; NUNES GOUSSAIN FILIPPO, ANA LUIZA; CAMPOS, GABRIELE DA SILVA; DO REGO, FRANCISCO; SIQUEIRA, ELLEN DE SOUZA; FARIAS DE ALCANTARA, NAJILA; ZACHI, ELAINE CRISTINA; PASSOS-BUENO, MARIA RITA. Catatonia and regression in an autism spectrum disorder patient harbouring a BRSK2 frameshift mutation. JOURNAL OF MEDICAL GENETICS, v. N/A, p. 6-pg., . (24/21989-5, 24/10059-7, 13/08028-1)