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Estatística de redes: teoria, métodos e aplicações

Processo:18/21934-5
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2019
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2024
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:André Fujita
Beneficiário:André Fujita
Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Pesquisadores principais:
Helder Takashi Imoto Nakaya ; João Ricardo Sato
Pesquisadores associados: Abner Cardoso Rodrigues Neto ; Alexandre Alarcon Steiner ; Alexandre Galvão Patriota ; Andrea Parolin Jackowski ; Ariel Mariano Silber ; Carlos Alberto Moreira Filho ; Carlos Eduardo Ferreira ; Claudinei Eduardo Biazoli Junior ; Cristina Gomes Fernandes ; Daniel Yasumasa Takahashi ; David Corrêa Martins Junior ; Elisa Harumi Kozasa ; Fabricio Martins Lopes ; Itamar de Souza Santos ; Joana Bisol Balardin ; João Paulo Papa ; José Carlos Farias Alves Filho ; Mari Cleide Sogayar ; Patricia Severino ; Rodrigo Affonseca Bressan ; Ronaldo Fumio Hashimoto ; Silvia Yumi Bando Takahara ; Thiago Mattar Cunha
Auxílio(s) vinculado(s):19/22845-9 - Abordagens computacionais com o objetivo de explorar interações intra e inter espécies e seu papel em todos os domínios da vida, AP.R SPRINT
Bolsa(s) vinculada(s):23/13418-5 - Inferências sobre o acoplamento de redes cerebrais intersujeitos em crianças durante tarefas cooperativas: um estudo de espectroscopia no infravermelho próximo, BP.TT
23/12217-6 - A relevância de canais de curta distância no desenvolvimento de espectroscopia funcional no infravermelho próximo: avaliação em redes funcionais, BP.TT
21/10289-4 - Implementação de algoritmos eficientes para estatística de redes., BP.IC
 + mais bolsas vinculadas 20/13595-6 - Análise das evidências cognitivas, comportamentais e de neuroimagem para a teoria do cérebro masculino extremo no autismo, BP.MS
19/26284-1 - Criando um grafo de conhecimento biológico através do Wikidata com foco no projeto Human Cell Atlas, BP.DR
20/02415-7 - StatGraph 2.0 e um massivo curso online gratuito (MOOC), BP.PD
19/17907-5 - Inferências de conexões intercerebrais com utilização de espectroscopia de infravermelho próximo: investigação de interações adulto-criança, BP.DD
19/16418-0 - Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas, BP.DD
19/14879-0 - Investigação dos correlatos neurais da leitura e escrita em crianças: um estudo baseado em fNIRS., BP.IC
19/12098-1 - Análise de dados de imagens ressonância magnética funcional de pacientes diagnosticados com esquizofrenia, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Aprendizado computacional  Biologia computacional  Neurociências  Big data  Biologia de sistemas  Estatística computacional 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Aprendizagem de Maquina | big data | bioinformática | biologia de sistemas | estatística computacional | Neurociência | Estatística computacional

Resumo

A importância da Estatística nas ciências naturais é inquestionável. A Estatística é essencial para analisar dados de forma apropriada e também obter conclusões confiáveis. No entanto, pouco se é conhecido sobre métodos estatísticos formais em grafos e suas propriedades teóricas mesmo com o aumento no número de artigos relacionados com redes do mundo real (por ex., redes funcionais de cérebro, redes de interação proteína-proteína, redes de interação social). Redes são geralmente analisadas usando algoritmos computacionais baseados na teoria do grafos, como cálculo de medidas de centralidades (importância relativa dos vértices e/ou arestas) ou identificação de padrões estruturais (motivos). O principal problema com esta abordagem é o fato de redes do mundo real apresentarem flutuações intrínsecas (ruído aleatório) que os algoritmos tradicionais não levam em consideração. Portanto, métodos com perspectiva estatística podem auxiliar e complementar essas análises. A proposta deste projeto é de desenvolver desde a teoria e métodos estatístico-computacionais para grafos como também aplica-los em dados do mundo real, como as advindas da biologia molecular, neuroimagem e dados cardíacos. O desenvolvimento deste projeto será essencial para obter novos insights, solidificar a cooperação entre os pesquisadores e melhorar a qualidade na pesquisa dos grupos envolvidos. A longo prazo, pretendemos consolidar a área de Estatística de Redes, formar grupos de pesquisadores altamente qualificados, e finalmente, construir um Centro de Estatística de Redes no Brasil. Este centro atuará tanto no desenvolvimento teórico e de novas metodologias quanto nas aplicações em problemas das ciências da saúde. (AU)

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Publicações científicas (102)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
MARCOS ANTÔNIO MACÊDO; JOÃO RICARDO SATO; RODRIGO A. BRESSAN; PEDRO MARIO PAN. Adolescent depression and resting-state fMRI brain networks: a scoping review of longitudinal studies. Revista Brasileira de Psiquiatria, . (14/50917-0, 18/04654-9, 18/21934-5)
BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. Neuroinflammation at single cell level: What is new?. Journal of Leukocyte Biology, . (13/08216-2, 18/21934-5, 17/50137-3, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/22504-1, 17/21363-5, 18/14933-2, 19/06372-3)
DE SOUZA, RENATO WILLIAM R.; DE OLIVEIRA, JOAO VITOR CHAVES; PASSOS, JR., LEANDRO A.; DING, WEIPING; PAPA, JOAO P.; DE ALBUQUERQUE, VICTOR HUGO C.. . IEEE TRANSACTIONS ON FUZZY SYSTEMS, v. 28, n. 12, p. 3076-3086, . (13/07375-0, 17/25908-6, 18/21934-5, 16/19403-6, 14/12236-1)
GUZMAN, GROVER E. C.; FUJITA, ANDRE. . JOURNAL OF COMPLEX NETWORKS, v. 11, n. 2, p. 15-pg., . (19/22845-9, 18/21934-5)
MORETTI, EDUARDO H.; RODRIGUES, ABNER C.; MARQUES, BRUNO V.; TOTOLA, LEONARDO T.; FERREIRA, CAROLINE B.; BRITO, CAMILA F.; MATOS, CAROLINE M.; DA SILVA, FILIPE A.; SANTOS, ROBSON A. S.; LOPES, LUCIANA B.; et al. . PNAS NEXUS, v. 2, n. 2, p. 13-pg., . (18/13877-1, 20/00631-4, 18/03418-0, 20/09399-7, 15/23376-1, 18/21934-5)
SOARES JR, RAIMUNDO DA SILVA; LUKASOVA, KATERINA; CARTHERY-GOULART, MARIA TERESA; SATO, JOAO RICARDO. . FRONTIERS IN PSYCHOLOGY, v. 12, . (19/25795-2, 18/04654-9, 18/21934-5)
TOVAR, CARLOS R. P.; MARTINS-, DAVID C., JR.; ROZANTE, LUIZ C. S.; ARAUJO, ELOI; IEEE COMP SOC. . 2022 IEEE 22ND INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOENGINEERING (BIBE 2022), v. N/A, p. 6-pg., . (18/18560-6, 18/21934-5)
QUEIROZ DE PAIVA, JOSELISA PERES; MAGALHAES, SAMIR CAMARA; MOURA, LUCIANA MONTEIRO; SATO, JOAO RICARDO; AMARO JR, EDSON; STERR, ANNETTE; SCHLAFFKE, LARA; ECKELI, ALAN LUIZ; PRADO, GILMAR FERNANDES; CONFORTO, ADRIANA BASTOS. . Sleep Medicine, v. 73, p. 11-pg., . (18/04654-9, 18/21934-5)
TRAMBAIOLLI, LUCAS R.; TOSSATO, JULIANA; CRAVO, ANDRE M.; BIAZOLI, JR., CLAUDINEI E.; SATO, JOAO R.. . PLoS One, v. 16, n. 1, . (18/21934-5, 18/04654-9, 15/17406-5, 17/05225-1)
PINTO, BRUNA G. G.; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; SINGH, YOUVIKA; JIMENEZ, LEANDRO; GONCALVES, ANDRE N. A.; OGAVA, RODRIGO L. T.; CREIGHTON, RACHEL; SCHATZMANN PERON, JEAN PIERRE; NAKAYA, I, HELDER. . Journal of Infectious Diseases, v. 222, n. 4, p. 556-563, . (12/19278-6, 18/14933-2, 18/21934-5, 13/08216-2, 17/50137-3)
BRUIN, WILLEM B.; TAYLOR, LUKE; THOMAS, RAJAT M.; SHOCK, JONATHAN P.; ZHUTOVSKY, PAUL; ABE, YOSHINARI; ALONSO, PINO; AMEIS, STEPHANIE H.; ANTICEVIC, ALAN; ARNOLD, PAUL D.; et al. . TRANSLATIONAL PSYCHIATRY, v. 10, n. 1, p. 12-pg., . (11/21357-9, 18/04654-9, 18/21934-5)
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GARCIA-DIAS, RAFAEL; SCARPAZZA, CRISTINA; BAECKER, LEA; VIEIRA, SANDRA; PINAYA, WALTER H. L.; CORVIN, AIDEN; REDOLFI, ALBERTO; NELSON, BARNABY; CRESPO-FACORRO, BENEDICTO; MCDONALD, COLM; et al. . NeuroImage, v. 220, . (18/21934-5, 18/04654-9)
SOARES JR, RAIMUNDO DA SILVA; BARRETO, CANDIDA; SATO, JOAO R.. . SOUTH AFRICAN JOURNAL OF CHILDHOOD EDUCATION, v. 13, n. 1, p. 8-pg., . (18/04654-9, 18/21934-5)
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REBELLO, KEILA; MOURA, LUCIANA M.; XAVIER, GABRIELA; SPINDOLA, LETICIA M.; CARVALHO, CAROLINA MUNIZ; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; GADELHA, ARY; PICON, FELIPE; PAN, PEDRO MARIO; ZUGMAN, ANDRE; et al. . JOURNAL OF PSYCHOSOMATIC RESEARCH, v. 127, . (13/08531-5, 18/21934-5, 14/50917-0, 14/07280-1, 18/04654-9)
PIRES, RAFAEL G.; SANTOS, DANIEL S.; SOUZA, GUSTAVO B.; LEVADA, ALEXANDRE L. M.; PAPA, JOAO PAULO; TETKO, IV; KURKOVA, V; KARPOV, P; THEIS, F. . ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS AND MACHINE LEARNING - ICANN 2019: WORKSHOP AND SPECIAL SESSIONS, v. 11731, p. 12-pg., . (14/16250-9, 14/12236-1, 16/19403-6, 18/21934-5)
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LUSCHER-DIAS, THOMAZ; SIQUEIRA DALMOLIN, RODRIGO JULIANI; AMARAL, PAULO DE PAIVA; ALVES, TIAGO LUBIANA; SCHUCH, VIVIANE; FRANCO, GLORIA REGINA; NAKAYA, HELDER I.. . ISCIENCE, v. 25, n. 1, p. 22-pg., . (18/14933-2, 18/21934-5)
CUNHA, MATEUS TRINCONI; DE SOUZA BORGES, ANA PAULA; JARDIM, VINICIUS CARVALHO; FUJITA, ANDRE; DE CASTRO JR, GILBERTO. . CANCER MEDICINE, v. N/A, p. 11-pg., . (15/22814-5, 16/20187-6, 18/21934-5, 19/03615-2)
GUZMAN, GROVER E. C.; STADLER, PETER F.; FUJITA, ANDRE. . JOURNAL OF COMPLEX NETWORKS, v. 10, n. 5, p. 15-pg., . (20/08343-8, 19/22845-9, 18/21934-5)
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BAECKER, LEA; DAFFLON, JESSICA; DA COSTA, PEDRO F.; GARCIA-DIAS, RAFAEL; VIEIRA, SANDRA; SCARPAZZA, CRISTINA; CALHOUN, VINCE D.; SATO, JOAO R.; MECHELLI, ANDREA; PINAYA, WALTER H. L.. . Human Brain Mapping, v. 42, n. 8, . (18/21934-5, 18/04654-9)
SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI JR, CLAUDINEI EDUARDO; MOURA, LUCIANA MONTEIRO; CROSSLEY, NICOLAS; ZUGMAN, ANDRE; PICON, FELIPE ALMEIDA; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; AMARO JR, EDSON; MIGUEL, EURIPEDES CONSTANTINO; ROHDE, LUIS AUGUSTO; et al. . BRAIN CONNECTIVITY, v. 9, n. 5, p. 379-387, . (16/04983-7, 13/08531-5, 18/21934-5, 14/50917-0, 18/04654-9)
JARDIM, VINICIUS CARVALHO; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; FUJITA, ANDRE; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. . FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . (14/50884-5, 18/21934-5, 16/13422-9, 15/21162-4, 08/57908-6)
BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. . Journal of Leukocyte Biology, v. 108, n. 4, p. 9-pg., . (17/22504-1, 13/08216-2, 18/14933-2, 19/06372-3, 17/21363-5, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/50137-3, 18/21934-5)
SIQUEIRA, RODRIGO A. DE O.; STEFANES, MARCO A.; ROZANTE, LUIZ C. S.; MARTINS-JR, DAVID C.; DE SOUZA, JORGE E. S.; ARAUJO, ELOI; GERVASI, O; MURGANTE, B; MISRA, S; GARAU, C; et al. . COMPUTATIONAL SCIENCE AND ITS APPLICATIONS, ICCSA 2021, PT I, v. 12949, p. 16-pg., . (18/21934-5, 18/18560-6)
OKU, AMANDA YUMI AMBRIOLA; SATO, JOAO RICARDO. . FRONTIERS IN HUMAN NEUROSCIENCE, v. 15, . (19/17907-5, 18/04654-9, 18/21934-5)
SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI, CLAUDINEI EDUARDO; ZUGMAN, ANDRE; PAN, PEDRO MARIO; ARANTES BUENO, ANA PAULA; MOURA, LUCIANA MONTEIRO; GADELHA, ARY; PICON, FELIPE ALMEIDA; AMARO JR, EDSON; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; et al. . European Journal of Neuroscience, v. 54, n. 6, . (18/21934-5, 16/19376-9, 13/08531-5, 14/50917-0, 18/04654-9)
RIBEIRO, ADELE HELENA; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. . Entropy, v. 23, n. 9, . (18/04654-9, 18/21934-5)
IWASHITA, ADRIANA SAYURI; RODRIGUES, DOUGLAS; GASTALDELLO, DANILO SINKITI; DE SOUZA, ANDRE NUNES; PAPA, JOAO PAULO. . COMPUTERS & ELECTRICAL ENGINEERING, v. 95, . (14/12236-1, 19/07665-4, 18/21934-5, 17/02286-0, 13/07375-0)
SANTOS, MARCUS VINICIUS C.; FELTRIN, ARTHUR S. S.; COSTA-AMARAL, ISABELE C. C.; TEIXEIRA, LILIANE R. R.; PERINI, JAMILA A. A.; MARTINS JR, DAVID C. C.; LARENTIS, ARIANE L. L.. . INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 24, n. 11, p. 18-pg., . (18/18560-6, 18/21934-5)
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NOGUEIRA, MATEUS G.; SILVESTRIN, MATEUS; BARRETO, CANDIDA S. F.; SATO, JOAO RICARDO; MESQUITA, RICKSON C.; BIAZOLI, CLAUDINEI; BAPTISTA, ABRAHAO F.. . BRAIN IMAGING AND BEHAVIOR, v. N/A, p. 12-pg., . (16/24951-2, 18/21934-5)
DOS SANTOS, PEDRO MACHADO NERY; MENDES, SERGIO LEONARDO; BIAZOLI, CLAUDINEI; GADELHA, ARY; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; MIGUEL, EURIPEDES CONSTANTINO; ROHDE, LUIS AUGUSTO; SATO, JOAO RICARDO. . FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 16, p. 12-pg., . (22/07782-3, 18/04654-9, 20/04119-6, 14/50917-0, 21/05332-8, 18/21934-5)
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GUZMAN, GROVER E. CASTRO; FUJITA, ANDRE. . INFORMATION SCIENCES, v. 581, p. 469-478, . (18/17996-5, 18/21934-5, 20/01479-1)
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