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Modelos e metodos de escience para ciencias da vida e agrarias. (fapesp-mct/cnpq/pronex-2011)

Processo:11/50761-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2012
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
Acordo de Cooperação: CNPq - Pronex
Pesquisador responsável:Roberto Marcondes Cesar Junior
Beneficiário:Roberto Marcondes Cesar Junior
Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Pesquisadores principais:
Carlos Alberto Moreira Filho ; Claudia Maria Bauzer Medeiros ; Luciano da Fontoura Costa
Auxílio(s) vinculado(s):14/50769-1 - Hand tracking for occupational therapy. (sprint 2014), AP.R SPRINT
15/05953-1 - ISMM 2015 - 12th International Symposium on Mathematical Morphology, AR.EXT
14/50135-2 - Learning salient elements from videos using structural and temporal information. (fapesp-cnrs 2014-2015), AP.R
+ mais auxílios vinculados 13/25918-0 - Visita do prof. Dr. Stéphane Canu ao IME-USP., AV.EXT
13/03535-2 - 11th International Symposium on Mathematical Morphology (ISMM 2013), AR.EXT
12/50986-7 - Graph spectra and complex network evolution. (fapesp-york), AP.R
12/08637-5 - Visita da Profa. Dr. Florence Tupin ao IME-USP, AV.EXT - menos auxílios vinculados
Bolsa(s) vinculada(s):16/13791-4 - Um arcabouço para análise e rastreamento de gestos de mão: casos com formas e movimentos não usuais, BP.DR
15/13430-9 - Enumerando histórias metabólicas multidimensionais: modelos e métodos, BP.PD
15/18942-8 - Associando Redes Complexas com Espaços Efetivos de Atributos, BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 15/18117-7 - Método para amostragem de experiências e intervenção programada (ESPIM), BP.PD
15/08003-4 - Abordagem de Redes Complexas em e-Science e Dados Dinâmicos, BP.PD
15/07252-0 - Documentos interativos para coleta especializada de experiências do cotidiano: operações para autoria, compartilhamento e análise, BP.DR
15/11693-2 - Programa de Atividades e Justificativa para Bolsa de Treinamento Técnico V: Gerente dos Projetos de Software Livre ligados ao Projeto Temático, BP.TT
14/24918-0 - Técnicas de Visão Computacional aplicadas a ambientes urbanos, BP.DR
15/03475-5 - Olhando para a cidade: big data e visão computacional para análise de ambientes urbanos, BP.IC
14/06549-7 - Programa de Atividades e Justificativa para Bolsa de Treinamento Técnico V: Gerente dos Projetos de Software Livre ligados ao Projeto Temático, BP.TT
13/00613-2 - Modelos e métodos de e-Science para ciências da vida e agrárias, BP.TT
12/19164-0 - Proposta de uma metodologia quantitativa de análise do jogo em esportes coletivos de invasão baseada em um modelo formal de estratégia: aplicação ao basquetebol e ao futebol, BP.PD
12/16072-8 - Gerente dos Projetos de Software Livre ligados ao Projeto Temático, BP.TT - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Banco de dados  Biologia computacional  Mineração de dados  Reconhecimento de padrões 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bancos De Dados | Bioinformatica | Biologia De Sistemas | Escience | Mineracao De Dados | Reconhecimento De Padroes

Resumo

A ciência moderna é crescentemente interdisciplinar e intensiva em dados. Na área de ciências da vida, por exemplo, com o surgimento de plataformas de alto desempenho para análise de imagens e estudos genômicos, o gargalo não está mais na aquisição de dados, mas sim no seu armazenamento, processamento, análise e visualização. Este cenário levou ao surgimento de um novo campo de pesquisa - eScience - que combina pesquisa avançada em computação e em modelagem matemática para permitir e acelerar pesquisa em outros domínios do conhecimento, desde as ciências exatas até as humanidades e artes. A eScience envolve a chamada "computação centrada em dados" (data-intensive computing), com a busca de soluções para gerenciamento de grandes volumes de dados produzidos por (e para) experimentos científicos, para que a descoberta científica não venha a ser detida pelo "dilúvio de dados". Este projeto visa a criação de uma rede colaborativa de eScience para acelerar pesquisa avançada em ciências da vida (biologia, medicina, oceanografia) e ciências agrárias. Está estruturado em tomo de cinco linhas de pesquisa - biologia de sistemas, planejamento de safras, computação visual, modelagem matemática e bancos de dados. Dentro dessas linhas, serão tratadas questões em aberto associadas às principais componentes de um ambiente de pesquisa em eScience: armazenamento, processamento, análise e visualização de grandes volumes de dados científicos. Os pesquisadores principais têm histórico de cooperação e coordenação de projetos nessas linhas. Questões de interoperalidade permeiam todo o projeto. (AU)

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Publicações científicas (148)
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CCACYAHUILLCA BEJAR, HANS HARLEY; MIRANDA, PAULO AV. Oriented relative fuzzy connectedness: theory, algorithms, and its applications in hybrid image segmentation methods. EURASIP JOURNAL ON IMAGE AND VIDEO PROCESSING, . (11/50761-2)
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JI, PENG; PERON, THOMAS K. D. M.; RODRIGUES, FRANCISCO A.; KURTHS, JUEURGEN. Analysis of cluster explosive synchronization in complex networks. Physical Review E, v. 90, n. 6, . (12/22160-7, 13/26416-9, 11/50761-2)
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SATO, JOAO RICARDO; BALARDIN, JOANA; VIDAL, MACIEL CALEBE; FUJITA, ANDRE. . JOURNAL OF PSYCHIATRY & NEUROSCIENCE, v. 41, n. 2, p. 124-132, . (14/09576-5, 11/50761-2)
DE ARRUDA, HENRIQUE F.; COSTA, LUCIANO DA F.; AMANCIO, DIEGO R.. . EPL, v. 113, n. 2, . (14/20830-0, 12/50986-7, 11/50761-2)
LIMA, WANIA REZENDE; MARTINS, DAVID CORREA; PARREIRA, KLEBER SIMONIO; SCARPELLI, PEDRO; DE MORAES, MIRIAM SANTOS; TOPALIS, PANTELIS; HASHIMOTO, RONALDO FUMIO; GARCIA, CELIA R. S.. . ONCOTARGET, v. 8, n. 69, p. 113987-114001, . (15/01587-0, 11/51295-5, 11/50761-2)
VILLAR COUTO, CYNTHIA MARTINS; COMIN, CESAR HENRIQUE; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. . MOLECULAR BIOSYSTEMS, v. 13, n. 10, p. 2024-2035, . (13/19082-7, 11/50761-2, 15/18942-8)
KOSER, DAVID E.; THOMPSON, AMELIA J.; FOSTER, SARAH K.; DWIVEDY, ASHA; PILLAI, EVA K.; SHERIDAN, GRAHAM K.; SVOBODA, HANNO; VIANA, MATHEUS; COSTA, LUCIANO DA F.; GUCK, JOCHEN; et al. . NATURE NEUROSCIENCE, v. 19, n. 12, p. 1592-1598, . (11/50761-2)
AZEVEDO, HATYLAS; RENESTO, PAULO GUILHERME; CHINEN, ROGERIO; NAKA, ERIKA; CARVALHO DE MATOS, ANA CRISTINA; CENEDEZE, MARCOS ANTONIO; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO; SARAIVA CAMARA, NIELS OLSEN; PACHECO-SILVA, ALVARO. . HUMAN GENOMICS, v. 10, . (11/50761-2, 12/02270-2, 09/53443-1)
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