CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco

• Processo: 13/08028-1
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Vigência: 01 de julho de 2013 - 30 de junho de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Mayana Zatz
• Beneficiário: Mayana Zatz
• Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Ana Cristina Victorino Krepischi ; Angela Maria Vianna Morgante ; Carla Rosenberg ; Celia Priszkulnik Koiffmann ; Eliana Maria Beluzzo Dessen ; Ésper Abrão Cavalheiro ; Maria Rita dos Santos e Passos Bueno ; Mariz Vainzof ; Merari de Fátima Ramires Ferrari ; Oswaldo Keith Okamoto ; Peter Lees Pearson ; Regina Célia Mingroni Netto
• Pesq. associados: Ana Cristina Victorino Krepischi ; Angela Maria Vianna Morgante ; Carlos Frederico Martins Menck ; Celia Priszkulnik Koiffmann ; David Schlesinger ; Débora Romeo Bertola ; Edson Amaro Junior ; Fernando Kok ; Joao Paulo Fumio Whitaker Kitajima ; Jorge Elias Kalil Filho ; Luciana Amaral Haddad ; Luis Eduardo Soares Netto ; Maria Dulcetti Vibranovski ; Maria Lúcia Lebrão ; Merari de Fátima Ramires Ferrari ; Miguel Mitne Neto ; Nivaldo Alonso ; Peter Lees Pearson ; Rita de Cássia Mingroni Pavanello ; Tatiana Teixeira Torres ; Valdemir Melechco Carvalho ; Venancio Avancini Ferreira Alves ; Verônica Porto Carreiro de Vasconcellos Coelho ; Yeda Aparecida de Oliveira Duarte
• Auxílios(s) vinculado(s): 20/05949-2 - Diagnóstico molecular rápido, eficaz e de baixo custo do COVID-19 e estratégias para testagem populacional em larga escala, AP.R; 19/05654-5 - Análise de perda de sequências de DNA satélite do tipo alfoide em regiões centroméricas na população geral e em tumores pediátricos, AV.EXT; 16/50021-2 - Cancer stem cell interactome mapping, AP.R SPRINT; 14/20796-7 - Synaptopathies in neurodevelopmental disorders: SHANK mutations as a window into synaptic function, AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/00689-5 - Desenvolvimento de receptor quimérico de antígeno tumoral com aplicação no tratamento de glioblastoma, BP.MS; 20/11495-4 - Investigação de variantes de risco em pacientes com o Transtorno do Espectro Autista, BP.IC; 20/08189-9 - Caracterização in vitro do estado redox e da expressão de TCOF1 durante o desenvolvimento craniofacial humano, BP.IC; + mais bolsas vinculadas 19/21290-3 - Desenvolvimento de banco de dados de variantes genéticas DesBraVar (Depósito de Sequencias Brasileiras e Variantes), BP.TT; 19/19998-8 - Desenvolvimento de pipeline para análise de copy number variation (CNVs), BP.TT; 19/20768-7 - Desenvolvimento e implementação de ferramentas para processamento de dados NGS e de bancos de dados para análise e armazenamento de variantes genéticas, BP.TT; 19/18469-1 - Desenvolvimento de organoides hepáticos universais produzidos a partir de células IPS, BP.PD; 18/08486-3 - Investigação das bases genéticas da Obesidade Sindrômica e de mecanismos moleculares relacionados à sua fisiopatologia, BP.DR; 18/05961-2 - Identificação variantes genéticas relacionadas à predisposição a câncer em coorte de pacientes com tumores embrionários e tumores pediátricos com sinais clínicos adicionais, BP.PD; 18/20373-0 - Caracterização do interatoma proteico do fator de pluripotência L1TD1 em células-tronco tumorais e normais do sistema nervoso central, BP.IC; 16/14517-3 - Identificação de variantes/mecanismos protetores em indivíduos com mutação patogênica no gene SPAST assintomáticos ou levemente afetados, BP.PD; 17/16283-2 - Desenvolvimento de técnicas de bioengenharia de tecidos para a reconstrução funcional, ex vivo, de fígados, a partir de células iPSCs, BP.PD; 17/11430-7 - Interação de fatores genéticos e epigenéticos em resposta à inflamação na predisposição às fissuras lábio-palatinas, BP.PD; 17/05824-2 - Investigação de alterações de novo de risco em país de pacientes com o Transtorno do Espectro Autista, BP.DR; 16/23648-4 - Investigação da relevância etiológica de novos genes candidatos às fissuras orofaciais, BP.PD; 16/24188-7 - Modelagem da síndrome de Richieri-Costa-Pereira com uso de células-tronco pluripotentes induzidas, BP.PD; 16/17392-7 - Estudo de associação de variantes raras em genes candidatos à fissuras orofaciais na população brasileira, BP.DR; 15/18914-4 - Estudo do potencial regenerativo das células satélite na miopatia centronuclear e a capacidade miogênica de suas microvesículas liberadas, BP.DR; 15/19435-2 - Avaliação terapêutica de imunoglobulina G humana em modelo murinho para Distrofia Muscular de Duchenne, BP.IC; 15/18130-3 - Análise da via autofágica no músculo distrófico, BP.MS; 15/14821-1 - DESENVOLVIMENTO DE BY-PASS VASCULAR HEPÁTICO FUNCIONALIZADO COM CÉLULAS HUMANAS DERIVADAS DE iPSCs, BP.DR; 14/23043-0 - Identificação de miRNAs com função crítica em neurogênese e oncogênese, BP.PD; 15/08563-0 - Regulação da DYRK1A pôr microRNAs em cultura de neurônios do hipocampo de camundongos modelo da trissomia do cromossomo 21 humano e sua relação com a Doença de Alzheimer, BP.IC; 15/06786-1 - Estresse do retículo endoplasmático e expressão da VAPB e Rab1 em cultura de neurônios motores de camundongos modelo da Esclerose Lateral Amiotrófica, BP.IC; 14/24541-3 - Emprego de fusões com GFP para análise dos mecanismos da toxicidade da proteína humana VAPB expressa em Saccharomyces cerevisiae, BP.IC; 14/17132-0 - Uso de Next Generation Sequencing na avaliação de cariótipos com número variável de cópias do cromossomo X, BP.PD; 14/13056-7 - Caracterização de INDELs e CNVs pequenos em pacientes com transtorno do espectro autista, BP.MS; 14/10519-6 - Via de sinalização hippo e divisão assimétrica de células-tronco tumorais derivadas de meduloblastoma humano, BP.PD; 13/14996-0 - Detecção de doenças genéticas fetais através de teste pré-natal não invasivo utilizando sequenciamento de nova geração, BP.DR; 12/09950-9 - Evolução de genes HLA: diferenciação populacional e sinais de seleção recente em populações nativas e miscigenadas do Brasil, BP.PD; 12/50154-1 - Identificação de proteínas ligantes da conexina 26, BP.PD; 11/50856-3 - Papel do microambiente celular nos mecanismos moleculares de resistência a quimioterápicos em modelo de carcinoma mamário humano, BP.PD; 11/50595-5 - Investigação de novos genes de susceptibilidade à hipertensão essencial em afro-brasileiros, BP.PD; 09/52523-1 - Obesidade sindrômica: pesquisa de genes e segmentos cromossômicos associados à obesidade, descrição de novas síndromes e da variabilidade fenotípica em síndromes reconhecidas, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Células-tronco Envelhecimento Doenças genéticas Doenças neurodegenerativas

Resumo

O Centro de Estudos do Genoma Humano (CEGH-CEPID I) foi estabelecido em 2000 com o objetivo principal de ampliar conhecimentos básicos sobre as doenças genéticas prevalentes na população brasileira e possibilitar o diagnóstico de doenças genéticas. O CEGH concentrou-se basicamente em doenças Mendelianas, principalmente neuromusculares, craniofaciais e deficiência mental. Em 2005, as pesquisas foram expandidas com a introdução do estudo de células-tronco como ferramenta para entender a expressão gênica e a diferenciação nas doenças genéticas e avaliar o seu potencial terapêutico. Além disso, abordamos aspectos da regulação da expressão gênica em distúrbios complexos, tais como autismo e várias doenças neurodegenerativas. Entretanto, a complexidade desses mecanismos evidenciada pelo Projeto Genoma Humano e os modestos avanços na medicina translacional abriram novos campos de investigação. Para o CEPID, expandimos o escopo científico com a inclusão do estudo do envelhecimento, de doenças degenerativas e de fatores como a instabilidade genômica que podem contribuir para esses processos; o papel do mecanismo de imprinting na manifestação de doenças; quais fatores determinam as diferenças individuais na degeneração cerebral, o que constitui um crescente ônus à saúde pública com o aumento da expectativa de vida da população mundial; e, o que determina a variabilidade fenotípica entre indivíduos portadores da mesma mutação. Para investigar essas questões, usaremos métodos atualizados, como sequenciadores de segunda geração e aparelhos sofisticados de isolamento de células, interagiremos com pesquisadores especialistas em suas áreas, otimizaremos a sinergia entre os grupos e também colaborações nacionais e internacionais. A proposta também enfoca a medicina translacional visando à tradução do conhecimento, principalmente na aplicação de células troncos em estudos pré-clínicos e testes terapêuticos para algumas doenças específicas. O grande número de pacientes atendidos e registrados no nosso centro - o maior da América Latina - e a variabilidade étnica da população brasileira proporcionam uma base extremamente rica para esses estudos. Acreditamos que o conhecimento gerado pelo CEPID 11 terá um grande impacto na qualidade da assistência às doenças genéticas no Brasil. Entretanto, um projeto tão ambicioso e integrado só pode ser realizado mediante a flexibilidade e a segurança de longo prazo, possibilitados pelo financiamento CEPID/FAPESP. (AU)

Publicações científicas

(130)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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NASLAVSKY, MICHEL SATYA; VIDIGAL, MATEUS; BARROS MATOS, LARISSA DO REGO; CORIA, VIVIAN ROMANHOLI; BATISTA JUNIOR, PEDRO BENEDITO; RAZUK, ALVARO; NASCIMENTO SALDIVA, PAULO HILARIO; DOLHNIKOFF, MARISA; SCHIDLOWSKI, LAIRE; PRANDO, CAROLINA; CUNHA-NETO, EDECIO; CONDINO-NETO, ANTONIO; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; ZATZ, MAYANA. Extreme phenotypes approach to investigate host genetics and COVID-19 outcomes. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 44, n. 1, 1 2021. Citações Web of Science: 0.

BERTOLA, DEBORA R.; CASTRO, MATHEUS A. A.; YAMAMOTO, GUILHERME L.; HONJO, RACHEL S.; CERONI, JOSE RICARDO; BUSCARILLI, MICHELE M.; FREITAS, AMANDA B.; MALAQUIAS, ALEXSANDRA C.; PEREIRA, ALEXANDRE C.; JORGE, ALEXANDER A. L.; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; KIM, CHONG A. Phenotype-genotype analysis of 242 individuals with RASopathies: 18-year experience of a tertiary center in Brazil. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART C-SEMINARS IN MEDICAL GENETICS, v. 184, n. 4, SI, p. 896-911, DEC 2020. Citações Web of Science: 2.

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SOUZA, LUCAS SANTOS; ALMEIDA, CAMILA FREITAS; YAMAMOTO, GUILHERME LOPES; MINGRONI PAVANELLO, RITA DE CASSIA; GURGEL-GIANNETTI, JULIANA; DA COSTA, SILVIA SOUZA; ANEQUINI, ISABELA PESSA; DO CARMO, SILVANA AMANDA; WANG, JAQUELINE YU TING; SCLIAR, MARILIA DE OLIVEIRA; CASTELLI, ERICK C.; OTTO, PAULO ALBERTO; ZANOTELI, EDMAR; VAINZOF, MARIZ. Manifesting carriers of X-linked myotubular myopathy Genetic modifiers modulating the phenotype. NEUROLOGY-GENETICS, v. 6, n. 5 OCT 2020. Citações Web of Science: 0.

AMARAL, MURILO SENA; GOULART, ERNESTO; CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; GOMES, ROSELANE PAIVA; OLBERG, GIOVANNA GONCALVES DE OLIVEIRA; ASTRAY, RENATO MANCINI; KALIL, JORGE E.; ZATZ, MAYANA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 8 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.

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VILLELA, DARINE; DE BARROS, JULIANA SOBRAL; DA COSTA, SILVIA SOUZA; AGUIAR, TALITA F. M.; CAMPAGNARI, FRANCINE; VIANNA-MORGANTE, ANGELA M.; KREPISCHI, ANA C. V.; ROSENBERG, CARLA. Detection of mosaicism for segmental and whole chromosome imbalances by targeted sequencing. ANNALS OF HUMAN GENETICS, v. 85, n. 1 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.

RAJPUROHIT, CHETAN SINGH; KUMAR, VIVEK; CHEFFER, ARQUIMEDES; OLIVEIRA, DANYLLO; ULRICH, HENNING; OKAMOTO, OSWALDO KEITH; ZATZ, MAYANA; ANSARI, UZAIR AHMAD; KHANNA, VINAY KUMAR; PANT, ADITYA BHUSHAN. Mechanistic Insights of Astrocyte-Mediated Hyperactive Autophagy and Loss of Motor Neuron Function in SOD1(L39R)Linked Amyotrophic Lateral Sclerosis. Molecular Neurobiology, JUL 2020. Citações Web of Science: 0.

KAID, CAROLINI; DOS SANTOS MADI, RAQUEL AZEVEDO; ASTRAY, RENATO; GOULART, ERNESTO; CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; MITSUGI, THIAGO GIOVE; RAMOS MORENO, ANA CAROLINA; CASTRO-AMARANTE, MARIA FERNANDA; PEREIRA, LENNON RAMOS; MILAZZOTTO MALDONADO PORCHIA, BRUNA FELICIO; DE ANDRADE, THAIS OLIVEIRA; LANDINI, VIVIAN; SANCHES, DANIEL SOARES; PIRES, CAROLINA GONCALVES; OLIVEIRA TANIOKA, RUBENS KOJI; PEREIRA, MARCIA C. L.; BARBOSA, IGOR NEVES; MASSOCO, CRISTINA O.; DE SOUZA FERREIRA, LUIS CARLOS; OKAMOTO, OSWALDO KEITH; ZATZ, MAYANA. Safety, Tumor Reduction, and Clinical Impact of Zika Virus Injection in Dogs with Advanced-Stage Brain Tumors. MOLECULAR THERAPY, v. 28, n. 5, p. 1276-1286, MAY 6 2020. Citações Web of Science: 0.

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